Publicatie van een ISIS databank op het web Els Mertens - juni 2003 WWWIRIS Publicatie van een ISIS databank op het web Els Mertens - juni 2003

Wat heb je nodig ? Een databank gemaakt in winisis Webserver : bv APACHE WWWiris (de websoftware voor ISIS) …en heel veel tijd…

Winisis : twee databanken Biomed - bevat referenties van tijdschriftartikelen - geconverteerd vanuit Current Contents Bib - bevat bibliotheekbezit (tijdschriften) - geconverteerd vanuit bibliotheeksysteem Link/relatie tussen Biomed en Bib ( ISSN)

Biomed : velden Een zo ver mogelijk doorgedreven opsplitsing : 10 : Auteurs 20 : Titel artikel 30 : Titel Tijdschrift 40 : Volume 50 : Nummer 60 : Pagina’s 70 : Jaar 80 : ISSN 90 : Trefwoorden 100 : Samenvatting

Bib : velden 1 : ISSN 2 : Tijdschrifttitel 3 : Holdings - welke jaren/volumes aanwezig zijn - fysieke locatie in de bibliotheek 4 : URL van het tijdschrift op internet - bedoeld voor linking naar full text

Hoe ziet het er uit ? in Winisis in WWWiris

Hoe doe je dat ?

Webserver : Apache Gratis webserver Halen bij Apache zelf : ingewikkelde procedure met verificatiecodes Eén essentiele file : httpd.conf - configuratiefile - werkt zonder wizzard (dus notepad) - bevat heel veel uitleg (regels met # ervoor) - hierin : alias en scriptalias aanmaken

Alias en scriptalias Alias /wwwiris/ "c:/wwwiris/" <Directory "c:/wwwiris/"> Options Indexes FollowSymLinks MultiViews AllowOverride None Order allow,deny Allow from localhost 127.0.0.1 DirectoryIndex index.php </Directory> ScriptAlias /wwwiris-cgi/ "c:/wwwiris/" Options Indexes FollowSymLinks MultiViews ExecCGI

Functie van (script)alias Vertelt webserver wat waar staat - Alias : verwijst naar folder waarin de html bestanden staan - Scriptalias : verwijst naar folder waar de scripts en executable staan Zet juiste rechten op die folders Geeft zo de mogelijkheid beveiliging in te bouwen

WWWIRIS - Aan te passen files Wirmenu.htm = linkerframe van de webpagina - bevat verwijzing naar plaats waar .exe staat (hier benaming scriptalias gebruiken !) - bevat links naar help en info etc. - voor elke taal is een wirmenu file nodig Cipar file (dbs.cpr) - vertelt wwwiris waar de databank, toon en highlighting files staan - is hoofd- en kleinletter gevoelig

WWWIRIS (vervolg essentiële files) CSS file (dbs.css) - style sheet (te kopiëren van voorbeeld) Wirvars.js in Arrays (per taal) aangeven : - op welke velden (+ prefixen) gezocht kan worden - hoe de toonformaten (pft’s) heten - highlighting files benoemen

Voorbeeld array (Nederlands) dbs = new Array(); dbs[0] = new Array(); dbs[0][0]=new Array(); dbs[0][0][0]="BIOMED"; dbs[0][0][1]=new Array(); dbs[0][0][2]=new Array(); dbs[0][0][1][0]="AU=";dbs[0][0][2][0]="Auteurs"; dbs[0][0][1][1]="TI=";dbs[0][0][2][1]="Titel Artikel"; dbs[0][0][1][2]="JN=";dbs[0][0][2][2]="Titel Tijdschrift"; dbs[0][0][1][3]="YR=";dbs[0][0][2][3]="Jaar"; dbs[0][0][1][4]="IS=";dbs[0][0][2][4]="ISSN"; dbs[0][0][1][5]="KW=";dbs[0][0][2][5]="Trefwoorden"; dbs[0][0][1][6]="AB=";dbs[0][0][2][6]="Samenvatting"; dbs[0][0][3]=new Array(); dbs[0][0][3][0]="BIOMbool.fst"; dbs[0][0][3][1]="BIOMtext.fst"; dbs[0][0][4]=new Array();dbs[0][0][5]=new Array(); dbs[0][0][4][0]="biomesh";dbs[0][0][5][0]="lijst"; dbs[0][0][4][1]="biomefu";dbs[0][0][5][1]="lang"; dbs[0][0][6]="Biomedische databank"; Voegt zelf taalcode toe aan toonformaten

WWWIRIS (vervolg aan te passen files) Highlighting files - moeten er staan (werkend of niet) - met bepaalde naam DBNBOOL.FST en waarbij DBN = databanknaam DBNTEXT.FST dus BIOMBOOL en BIOMTEXT Display files (pft’s ofte toonformaten) - met bepaalde naam en voor elke taal : ldbnsh.pft en waarbij l = language (d = dutch) ldbnfu.pft dus dbiomesh en dbiomefu

Valkuilen In Winisis databank : alles met prefixen indexeren Wwwiris : veel files meegeleverd - overbodige - dubbele - voorbeeldfiles (handig hulpmiddel !) - essentiële files - zijn moeilijk van elkaar te onderscheiden - welke doet wat ? - sommige zijn vermeld in documentatie - andere niet Files in de juiste folders (met juiste namen) zien te plaatsen

Sommige dingen kan je gewoon niet weten bv : highlighting : in pft’s ‘proof modus’ kiezen Voor iconen : .ico-files wordt door Apache niet herkent, wel .jpg-files Link naar andere databank :in cipar file verwijzing naar die databank opnemen ! Debugging kan je opzetten, maar is beperkt Oorzaken errors : hoofd- vs kleine letters; komma’s, spaties….

Relatie tussen databanken - In Winisis : {cl1,fs24,'Journal website:'},tab(2667), LINK(('click here'), IF S(REF->bib(L->bib(v80),v4))='' THEN 'URL not available….. ' ELSE 'OPENFILE ', REF->bib(L->bib(v80), v4)/FI/)/ - Wordt in WWWiris : '<TR><TD WIDTH="30%" BGCOLOR="#CCCCCC" ><I>URL Tijdschrift </I></TD><TD BGCOLOR="LIGHTYELLOW" >', IF S(REF(['bib']L(['bib']v80),v4))='' THEN 'URL niet beschikbaar.' ELSE '<a href="', REF(['bib']L(['bib']v80),v4)'">klik hier</A></TD></TR>'/FI,/ Verschillen : - gebruik html codes (ook voor spaties, comma’s en dergelijke) - wwwiris : braziliaanse logica REF->bib(L->bib(v80),v4) wordt REF(['bib']L(['bib']v80),v4) - html formaat voor ‘LINK’ functie en ‘OPENFILE’ uit winisis LINK(('click here') en 'OPENFILE ' worden '<a href="', REF..'">klik hier</A>

Nog op te lossen problemen Highlighting : auteur wordt alleen gehighlight als het de eerste auteur van het artikel betreft Highlighting tijdschrifttitels : titels worden in keuzelijstje afgebroken op 27 karakters. Alles wat langer is wordt niet gehighlight. Bug ? Doorklikken op trefwoorden : werkt nog niet ‘Terug naar zoekscherm’- knop : achtergrondkleur verdwijnt. Andere taalkeuze : N->E kan, E->N taal statische info in linkerframe verandert niet mee. Bug ? Nog afwijkingen Engelse tov Nederlandse kant

Conclusie Winisis is krachtige software WWWIRIS een mooie aanvulling daarop Bovendien gratis maar er zijn een paar nadelen : Niet gebruiksvriendelijk Niet voor leken Te weinig gedocumenteerd