Ons onderzoek Waarom bioinformatica? Roos  biologisch/ medisch Inge  technisch Wat is onze onderzoeksvraag? • Hoe verschilt de aanwezigheid van cyanobacteriën.

Slides:



Advertisements
Verwante presentaties
9 oktober 2012 Kick off Centrum Duurzaam. Wat technisch mogelijk is Duurzaam doen.
Advertisements

Workshop Gegevens in BRON als basis voor de bekostiging
De mol.
Interactum Lectoraat Kantelende kennis
1 19 jan Urk. 2 de context van 2Korinthe 3  Paulus reageert op beschuldigingen dat hij onbevoegd zou zijn (3:1,2);  Paulus plaatst zijn Evangelie.
Guillotine.
28 juni 2009 Paëllanamiddag 1 Paëllanamiddag 28 juni 2009 Voorbereiding vrijdagavond (Loopt automatisch - 7 seconden)
Het ontstaan van de aarde (2)
Portfolio Website Tim Klijn Klas: MBI m1 Datum: 21 november 2007
De Nederlandse Kamer van Koophandel voor België en Luxemburg (NKVK) streeft ernaar het eerste aanspreekpunt te zijn bij grensverleggend zakendoen binnen.
AHS yes! 121research Wicher van Vreden 8 oktober
2 De strijd tegen het water
Ronde (Sport & Spel) Quiz Night !
Jezus over het koninkrijk 1. Marcus 1: 14. Nadat Johannes gevangen was genomen, ging Jezus naar Galilea, waar hij Gods goede nieuws verkondigde 15 Dit.
EMEG-lijst Kijk een The Lord of the Rings met het commentaar van de regisseur. Marciano Timmermans CE2A.
1. 12 DAAROM, gelijk door één mens de zonde de wereld is binnengekomen... 2.
Les 3 : 12 Oktober – 18 Oktober 2013 Offers HET HEILIGE HEILIGDOM Offers.
1. 3 Indien iemand een andere leer verkondigt en zich niet voegt naar de gezonde woorden van onze Here Jezus Christus*... * = de woorden die de Here Jezus.
Sociale Innovatie als ondernemingsstrategie WORKSHOP uur
ARBEIDSMARKT Op zoek naar ‘De Steen der Wijzen’ Transitie van student naar medewerker Roel Spaenhoven 22/10/13Hink Stap Sprong.
Inktvis Met 10 armen en niet met 8..
Zegen & vloek deel II.
"in geen ding bezorgd" 1.
1 19 dec Rijnsburg 19 dec Rijnsburg. 2 Hebreeën 8 1 De hoofdzaak VAN ONS ONDERWERP is, dat wij zulk een hogepriester hebben, die gezeten is.
Werken aan Intergenerationele Samenwerking en Expertise.
De vierkantjes ! Dit is een puzzel om uw hersens eens goed te laten werken. De vraag is bij elk figuur hoeveel vierkanten u ziet.
Levensstijl van het Koninkrijk van God. I. Garden Lifestyle Lifestyle is een mode woord.
Zaterdag 30 juni 2012 Wij waren nog nooit in Kijkduin geweest en waren vroeg op stap gegaan, zelfs in de winkels was het nog rustig.
Door : Lucas Van Der Haven
Het Heiligdom Een Afbeelding voor Redding 4e Kwartaal 2013 INLEIDING
Vragenlijst ketencoördinatoren
Mobiel Crisisteam Impact
Landelijke dag RMC- coördinatoren Aanpak uitrol Loket VSV 4 juni 2008.
Veldwerk 2008/2009 Opdracht: Plantensamenstelling en bedekking in het water Door Judith ter Weele en Ruth Kolthof, 5/6 S.
Psalm 99 : 1, 8 Psalm 116 : 1, 3, 10 Johannes 21 : 1 – 14
1 Controleplan 2005 Raadgevend comité Hotel President – donderdag 21 april 2005.
ZijActief Koningslust 10 jaar Truusje Trap
In opdracht van: In samenwerking met:OPENINGOPENING PAGINA 1 PROJECT “SCHOUWBROEKERPLAS”
G!DS Basismodule Trainingsdag 2 Naam, functie Datum, plaats.
2 januari 2009Nieuwjaarsreceptie "Meule wal straete" 1 Nieuwjaarsreceptie 2 januari 2009 Eerste bijeenkomst van de bewoners van de “Meule wal straete”
Beheer van de restfractie
Mijn museum Gemaakt door Xander.
CENTRAAL KERKBESTUUR GENT STAD
26 juni 2014 Bodegraven 1. 2 Terugblik... slot hfst. 14: laat alles in orde en tot opbouw geschieden. eerste verzen hfst. 15:  samenvatting van het Evangelie:
De financiële functie: Integrale bedrijfsanalyse©
1 Op weg naar de Mar Morto, het binnenzeetje op de foto hieronder.
De vierkantjes ! Dit is een puzzel om uw hersens eens goed te laten werken. De vraag is bij elk figuur hoeveel vierkanten u ziet.
Park van Luna, Heerhugowaard: lust of last?
Module 2: Heelal Door: Annemarie Leunissen, Roxane Giuntoni, Sinduja Sivapathasundaralingam en Stan Knoops.
1 16 jan Rijnsburg 16 jan Rijnsburg. 2 de vorige keer:  "de hoofdsom van het gezegde" (8:1)  de aankondiging van een nieuw verbond (8:8)
Lekvijver Oost-Souburg Sterk brak, gevoed door zoute kwel Al jaren een slechte kwaliteit Algenbloei Dode vissen Tijdelijk stinken Yvonne van Scheppingen.
Lucas 15: 11 En Hij zeide: Iemand had twee zonen
1 Zie ook identiteit.pdf willen denkenvoelen 5 Zie ook identiteit.pdf.
Strijd tegen de zonde?.
Doopdienst 22 juni 2014 Koen Minderhoud
Mijn ervaringen in (land). Intro  Naam/land/soort vrijwilligerswerk/voorbereiding etc. (Plaats op deze pagina bijvoorbeeld een mooie foto) 1.
13 november 2014 Bodegraven 1. 2 de vorige keer: 1Kor.15:29-34 indien er geen doden opgewekt worden...  vs 29: waarom dopen?  vs.30-32: waarom doodsgevaren.
Floodcom lesworkshop Hoofdpresentatie les
ZijActief Koningslust
Keuze-opdracht 3-1.
Stage bij “Het Licht”. Mijn stage bij “Het Licht” begon een beetje rommelig want ik kreeg op het laatste moment te horen dat ik mijn stage bij een ander.
Woordenschat groep 5, thema 6, les 3
De tafel van 4.
Wat was je verwachting vooraf?  Veel vechten, vechten staat centraal  Grafisch niet heel erg spectaculair  Een vage verhaallijn  Verslavend  Onduidelijk.
GETUIGENISSEN ‘MANTELZORGVRIENDELIJKE MANAGERS’. Getuigenis 1 Uit de organisatiescan die we onze medewerkers begin 2014 lieten invullen, bleek dat er.
Wat weet jij van hoeden en pruiken? De grote Quizzzz.
DEZE SLIDE NIET VERWIJDEREN
Transcript van de presentatie:

Ons onderzoek Waarom bioinformatica? Roos  biologisch/ medisch Inge  technisch Wat is onze onderzoeksvraag? • Hoe verschilt de aanwezigheid van cyanobacteriën en Escherichia coli op verschillende plaatsen en tijden in de Waal?

Ons onderzoek Hoe zijn we op deze onderzoeksvraag gekomen? Een aantal ideeën • Hoe zijn de vissen genetisch aangepast aan de vervuiling in de waal? • Huisplanten/ landplanten sterven bij een overvloed aan water, waterplanten echter niet. Wat is het gen dat dit mogelijk maakt is dit een algemeen gen voor alle waterplanten Soortenanalyse Overstroming riolen in Groesbeek

Hoe gaan we dat onderzoeken? Watersamples nemen • 3 keer over 4 maanden – 28 juni 2012 – 5 september 2012 – 22 oktober 2012 • 3 verschillende plekken in de Waal – Tussen de stenen – Aan het strandje – In de stroming Het protocol voor het nemen van de samples 1.voeg meteen 1.5 ml NaAc 3M toe 2.verzamel 15 ml water (in een falcon tube) 3.voeg 33 ml pure ethanol toe 4.vries in (-20C)

Hoe gaan we dat onderzoeken? • Sequenced (leve DNA Leiden) op 16s rRNA met behulp van de ion torrent • De resultaten werden ingestuurd naar MG-rast • opzoek naar E. coli en cyanobacteriën in de resultaten.

Resultaten Mg-rast

Onze ervaring Wat hebben we geleerd? • Werking van onderzoek • Beter overzicht van DNA • Metagenomics/ genomen • Hoe gaat een DNA-analyse precies in zijn werk. Waar liepen we tegenaan? • Soorten-/ functieanalyse • Sequencen duurde langer dan verwacht • DNA-kennis

Onze ervaring Wat was het leukst? • Het veldwerk Wat was bijzonder? • Het RNA uit onze zelf genomen samples bekijken