Michel Ebskamp 1 november 2012 Kansen voor de tuinbouw

Wat doet Naktuinbouw: Keuringen en inspecties van teeltmateriaal Diensten die kwaliteit verhogen Rassenonderzoek ten behoeve van kwekersrecht en registratie Nederlandse Algemene Kwaliteitsdienst Tuinbouw

Criteria voor het verlenen van kwekersrecht: Distinction - Onderscheidbaarheid Uniformity - Homogeniteit Stability- Stabiliteit Kunnen we met moleculaire technieken het rassenonderzoek ondersteunen? Rassenonderzoek

Variety Tracer Genetische analyses bij inbreuk op kwekersrecht Het ‘Sherlock Holmes’ concept in inbreuk zaken

Praktijk Voorbeeld - Freesia Achtergrondinformatie en Probleembeschrijving: Zowel ras A (1991) als ras B (2007) hebben kwekersrecht Rasbeschrijvingen zijn vergelijkbaar Onderzoeksvraag: Is ras B identiek of in essentie afgeleid van ras A?

Praktijk Voorbeeld BAAABBBBAAABBB refs bloemkleur clustering analyse – Jaccard

Praktijk Voorbeeld - Freesia Genetische variatie in de gehele dataset was hoog De DNA profielen van alle monsters van Ras A en Ras B waren identiek (100%) met de gebruikte reactiecondities De resultaten kunnen verklaard worden doordat: –Ras A en Ras B identiek zijn, of –Ras B in essentie afgeleid is van Ras A Conclusies

Pathogen Tracer Forensisch onderzoek bij uitbraken van plantenziektes Het ‘Track and Trace’ concept bij uitbraken

Database met pathogenen

Ontwikkeling/Toekomst DNA Genetische verwantschap op basis van de volledige DNA sequentie informatie Meer voor minder Grotere zekerheid Ook kleine verschillen detecteren (mutanten?) Koppeling DNA profiel aan raskenmerken

Nieuwe technologische doorbraak DNA: Volledige DNA sequentie bepaling van een organisme is mogelijk Hoe kunnen we deze technologie implementeren? Universiteit van Amsterdam

Samenwerking UvA en Naktuinbouw met Green Forensics als onderdelen: DNA: nieuwe sequentie technologiën Studenten: Master Forenscis Science Isotopen: Herkomstbepaling Green Life-Science Hub

Origin Tracer Forensisch onderzoek naar herkomst van materiaal

Vanuit het Keuringswerk werd de vraag gesteld: kunnen we aantonen waar uitgangsmateriaal vandaan komt? Waar zijn Esdoorns geproduceerd? Italië of China Consequenties voor fytosanitaire inspectie Komen (Nederlandse) eikels voor de opkweek van bosplantsoen echt uit officiële opstanden of zijn ze elders ingezameld? Komen Convallaria knollen echt uit Nederland (importeis VS)? Herkomstbepaling

Praktijkcase paprika Supermarkt twijfelt aan herkomst geleverde paprika’s (Israel/Egypte vs. Spanje) Leverancier wil onafhankelijke herkomstbepaling laten uitvoeren om wantrouwen leveranciers weg te nemen. Perfecte praktijkcase voor ontwikkeling ORIGIN tracer

Origin Tracer voor bomen

Origin Tracer voor herkomstbepaling Locatie –Geografisch Uniformiteit –Bijmengen vanuit andere (productie)locaties Preventie –Belangrijk dat er een techniek is voor bewijs Betrouwbare informatie voor de consument –Aantoonbare herkomst van producten

Variety Tracer Pathogen Tracer Origin Tracer Green Forensics Genetische analyses bij inbreuk op kwekersrecht Forensisch onderzoek bij uitbraken van plantenziektes Forensisch onderzoek naar herkomst van materiaal DNA Isotopen

Kansen en Crossovers..