Practicum Biochemie 2de Bach. Biomedische Wetenschappen   Voormiddag: start 8h30 Datum 7/nov 14/nov 21/nov 28/nov 5/dec 11/dec 12/dec Bioinformatica alle groepen Theor. Pract. Enz. Kinetiek 5 en 6 Eiwit-eiwit 3 en 4 Protease 6 1 3 Namiddag: start 13h 14h45 13h voorbereiding voorstelling 1 en 2 alle groepen 5 2 4

berlinda.vanloo@vib-ugent.be sldclerc.declercq@ugent.be Drs Sarah De Clerq Drs Kenneth Verheggen Dr Berlinda Vanloo Locatie Theor. Pract X Aud. P8 Bioinformatica UZ PC-zaal Marie-Curie P8 Enz. Kinetiek Practicumzaal Inst. Rommelaere Eiwit-Eiwit Protease Voorbereiding Voorstelling aud. P8 berlinda.vanloo@vib-ugent.be sldclerc.declercq@ugent.be Kenneth.Verheggen@UGent.be

DOEL VAN HET PRACTICUM Experimentele aanvulling bij begrippen uit de cursus Algemene Biochemie Experimentele vaardigheden aanleren reproduceerbaarheid veilig werken Waarnemen: wat gebeurt er? Hoe druk je dit kwantitatief of kwalitatief uit? Hoe gebeurt het? Waarom gebeurt het? Wat betekent dit wetenschappelijk? Nieuwe hypothesen Kritische reflectie Het wetenschappelijk rapporteren stimuleren verslag voorstelling

Theoretisch practicum Bioinformatica in silico 1) De profiline EVL interactie ELISA 2) Proteasen SDS PAGE 3) Enzymkinetiek Colorimetrie 1) Evenwichtsdissociatieconstante en de Scatchard vergelijking, 2) Protease-specificiteit, natief versus gedenatureerd, (kinetiek) 3) M.M.-enzymkinetiek en inhibitie

Bereid elk practicum voor Theoretisch practicum Verdunningen berekenen Theorievragen over de practicumnota’s

scheiding volgens grootte Protease - substraat (BSA) - trypsine versus chymotrypsine - natief versus gedenatureerd - met en zonder inhibitor - tijd - SDS-PAGE scheiding volgens grootte

maat voor productvorming Enzymkinetiek - substraatverdunningen - met en zonder inhibitor - colorimetrie - ijklijn S en 1/S V en 1/V maat voor productvorming KM Vmax Ki

Eiwit-eiwit interactie: het profiline EVL complex Ena/VASP His6 EVH1 EVH2 pL-pro Profline I en IIa actine

maat voor complexvorming [profiline] [EVL] geel maat voor complexvorming

Verslag (structuur van een wetenschappelijk artikel) - Inleiding: situering en doelstelling - Math. Meth: kort, geef de essentie - Resultaten: gels, tabellen van metingen, de berekeningen, grafieken, waarnemingen en besluiten - Discussie: - bespreek eigen resultaten in relatie tot elkaar - bespreek resultaten in relatie tot die van andere subgroepen. - wat zijn de beperkingen van het experiment, hoe zou je dit kunnen verbeteren? Verslagen afgeven op 11 dec (op het einde van de voorbereidingsnamiddag)

Veiligheid Labojas Veiligheidsbril Handschoenen Propipetten gebruiken Geen drank en eten Rookverbod Afval Restafval Papier Chemische afval (verschillende) Biologische afval Scherpe voorwerpen Afwas Voorbereiding

Veel succes