Mamaprint
Mammaprint Mammaprint genexpressieprofiel Heeft alleen zin als je weet wat de functie van het gen is!!
Tumordiagnostiek Zoek relevante genen: Groei Deling Differentiatie
Bijvoorbeeld Oncogenen: Regulatie van celgroei en celdeling Tumorsuppressorgenen: Genen die coderen voor eiwitten die celdeling stoppen
Kanker Ongecontroleerde deling Ontregeling door mutaties Kloon van abnormale cellen = tumor Goedaardig lokaal Kwaadaardig verspreiding (metastase)
Kanker Doodsoorzaak nr 2 Doodsoorzaak nr 1? Hart en vaatziekten
DNA chip Micro array: Bekende genen in vaste volgorde op glasplaat
Genexpressieprofiel Welke actieve genen Info over: Welk celtype is gaan woekeren Tumorstadium wat is de beste behandeling?
DNA sample
Micro array Iedere positie bevat enkelstrengs oligonucleotide
Actieve genen produceren mRNA
Reverse transriptase Maakt cDNA copy van mRNA cDNA = enkelstrengs Gelabeld met fluorochroom
Breek mRNA af
Elke positie bevat oligonucleotide Representatief voor gen Binding met cDNA van actief gen maakt mRNA
Indentificatie Groen= Actieve genen in controleweefsel
Identificatie Rood= Actieve genen in tumorweefsel
Identificatie Genen die in beide weefsels actief zijn
Interpretatie Vergelijken expressieprofiel controle + tumor weefsel