Welkom bij het CMBI Bioinformatica

Voorlichting BIOINFORMATICA Wat is bioinformatica? Studeren aan deze faculteit (FNWI, KUN) Bioinformatica vakken Stagemogelijkheden Masteropleiding Beroepsperspectief

Wat is Bioinformatica? Informatica + Bio = Bioinformatica

Wat is Bioinformatica? Bioinformatica probeert met hulp van computers biologische, chemische en medische vragen te beantwoorden.

Studeren aan deze faculteit VWO Jaar 1 Bachelor titel: Bachelor of Science Jaar 2 Jaar 3 Jaar 4 Master titel: Master of Science Jaar 5 Toekomstig beroep

Faculteit der Natuurwetenschappen, Wiskunde en Informatica (FNWI) 5 subfaculteiten scheikunde natuurkunde biologie wiskunde informatica Opleidingen - scheikunde - biologie & medische biologie - natuurwetenschappen - informatica - moleculaire levens- wetenschappen - life sciences - wiskunde - natuur- en sterrenkunde - milieu- natuur- wetenschappen

Bioinformatica = Masteropleiding Je kunt starten bij Bioinformatica Master als je een vooropleiding (bachelor) hebt in: -scheikunde -biologie -natuurwetenschappen -moleculaire levenswetenschappen -informatica -life sciences -biomedische gezondheidswetenschappen (medische faculteit)

Vakkenpakketten voor toelating tot de vooropleiding (bachelor) Scheikunde N&T; N&G; M-profiel+WiskB1,Sk1,Nat1;WiskB+Nat Biologie N&G; N&T Natuurwetenschappen N&T; N&G+WiskB2; M-profiel+WiskB1,Sk1,Nat1 Moleculaire Levenswetenschappen N&T; N&G; M-profiel+WiskB1,Sk1,Nat1 Informatica N&T; N&G+WiskB2

Bioinformatica vakken Je komt ons tijdens de vooropleiding al tegen! Verplichte vakken Keuze vakken Hands-on

Voorbeeld uit Bioinformatica I Welke tools en databases zijn er en hoe kun je ze toepassen? Databases met sequenties en structuren van eiwitten (o.m. via WWW); Zoekprogramma’s om gelijkenissen te vinden; Voorspellen eigenschappen van eiwitten Welke biowetenschappelijke vragen zijn hiermee te bestuderen? Hoeveel lijkt de mens op de aap (evolutie en homologie)? Hoe zal dit onbekende eiwit zich gedragen en er uitzien?

Bioinformatica II Bioinformatica II: Eiwitstructuur analyse 4 ECTS Voorkennis: bioinformatica I Overzicht en details van eiwitstructuren Hoe maak je een eiwit stabieler? Het bouwen van een eiwitmodel (Homology Modelling) Energieberekeningen Realworld voorbeelden

Bioinformatica III Bioinformatica III: Genoom Analyse 3 ECTS Voorkennis: bioinformatica I

Bioinformatica IV Bioinformatica IV: - Computational Drug Discovery 3 ECTS (optioneel: 4) Voorkennis: bioinformatica I & II

Bioinformatica V Bioinformatica V - applied bioinformatics 6 ECTS - voorkennis bioinformatica 1 projectmatig a.h.v. casus gericht op biologie; maar ook andere studenten zijn welkom

Invulling is afhankelijk van je eigen belangstelling en achtergrond! Stage mogelijkheden Invulling is afhankelijk van je eigen belangstelling en achtergrond! Voorbereiding: Bioinformatica II of III Bijvak & hoofdvak (6-12 maanden) Ministages (8 weken, derde jaar) Sommige stages zijn extern (andere universiteit of buitenland)

Bioinformatica onderzoek op het CMBI Gert Vriend: Bioinformatics of Protein Structures Martijn Huynen: Computational Genomics Roland Siezen: Bacterial Genomics Jacob de Vlieg: Computational Drug Discovery

Samenwerking

Enkele Stagevoorbeelden Voorspellen thermostabiliserende mutaties in eiwitten “hoe verbeter je eigenschappen van enzymen door engineering” Plaats en omringing van ionen in eiwitstructuren “zijn er regels af te leiden volgens welke de ionen in de eiwitstructuren zitten” Voorspellen van humane ziektegenen “The GeneSeeker” Webadres huidige stageplaatsen: http://www.cmbi.kun.nl/stages

Masteropleiding Bioinformatica Gestart in 2001/2002 2 jarige master opleiding bestaand uit: * 60 ECTS (1 jaar) tailormade vakkenpakket (bioinformatica, maar ook breed in chemie, biologie, informatica en/of geneeskunde) * 60 ECTS (1 jaar) bioinformatica research Titel: Master of Science in Bioinformatics Vooropleiding: Bachelor in chemie, biologie, Moleculaire Levenswetenschappen, Natuurwetenschappen, biomedische gezondheidswetenschappen, geneeskunde, informatica, life sciences, HLO, HIO Second Master variant (1 jarige opleiding) voor mensen die al een mastertitel hebben

Beroepsperspectief (1) Een bioinformaticus beheerst altijd ten minste twee disciplines. Werkt vaak in multidisciplinaire teams Is overal nodig waar computers de bioweten-schappen binnendringen: voedselindustrie, medicijnontwikkeling, diagnostische tests (“even een druppeltje bloed meneer, en in twee minuten weten we of u ziek bent”), wasmiddelen (enzymen), plantveredeling, etc.

Beroepsperspectief (2) VOORBEELDEN: Chemicus-bioinformaticus zal zijn baan vinden in farmaceutische- of voedingsmiddelenindustrie Bioloog-bioinformaticus gaat werken aan biologische datasets (o.a. genoom projecten) Bioinformaticus die de IT ingaat heeft waarschijnlijk een informatica achtergrond Bioinformaticus in ziekenhuis heeft waarschijnlijk gezondheidswetenschappen gestudeerd

Beroepsperspectief (3) Grote vraag uit bedrijfsleven Gunstige loopbaanperspectieven