De Bio- (&Geo-) Diversiteit van het CWI Arjen Doelman MAS, CWI & UvA.

Presentatie over: "De Bio- (&Geo-) Diversiteit van het CWI Arjen Doelman MAS, CWI & UvA."— Transcript van de presentatie:

1 De Bio- (&Geo-) Diversiteit van het CWI Arjen Doelman MAS, CWI & UvA

2 OPZET: Centraal staan een twaalftal voorbeelden van bestaande aan de aard- en levenswetenschappen gerelateerde onderzoeksprojecten op het CWI.  Een `one man poster session’ Andersoortige activiteiten: Aard  Leven Plannen en `synergie’ Opmerking: Naamgeving `posters’ gebaseerd op groepsleiders – een versimpeling, zij representeren tevens aio’s en andere co-auteurs. Het genoemde CWI-onderzoek is bijna zonder uitzondering uitgevoerd in samenwerking met aard- en/of levenswetenschappers.

3 Harry Buhrman/Peter Grunwald/Paul Vitanyi (INS4): Clustering & Similarity Analysis SARS is een Corona virus Een SARS virus Andere toepassingen: evolutiaire bomen, tekstanalyse

4 Leen Stougie (PNA1): Combinatorische optimalisatie  computationele biologie  `phylogenetic networks’  evolutionaire netwerk voor gistsoorten evolutionaire boom

5 ... Eric Pauwels (PNA4): Extractie en matching van patronen `ambient intelligence’/ visuele plaatsbepalingen & walvissen, dolfijnen, zeeschilpadden, bomen,... Dezelfde walvis in de data base Foto

6 skelet foto  Informatie over de groei/geschiedenis van het koraal  Kwantitatief meten aan biologische objecten Robert van Liere (INS3): Visualisatie & 3D oppervlakken

7 Jason Frank (MAS1): Statistisch accurate (klimaat)simulaties Simulatie KNMI (140 jaar)

8 Daan Crommelin (MAS1): Deduceren van modellen uit data Andere toepassingen: klimaatsdynamica, moleculaire dynamica,... Temperatuur oceaan oktober 2005 Voorspellingen Andere toepassingen: klimaatsdynamica, moleculaire dynamica,...

9 Jan van Schuppen (MAS2): `System reduction’, metabolische/proteine/genetische networks input ) output glycolyse netwerk gist

10 Antonios Zagaris (MAS1): Dynamische model reductie Een sterk vereenvoudigde verbrandingsreactie Laag dimensionaal gedrag in grote systemen  biochemische netwerken

11 Ute Ebert (MAS3): Multiscale analyse  Gasontladingen Sprites (50km) Laboratoriu m (4cm)  Toepassingen in de techniek

12 Joke Blom (MAS1): modelleren & simuleren biochemische processen  `Hybride’ systemen: Tussen continu (concentraties) en volledig discreet (moleculaire dynamica) Schalen: continu  discreet cel

13 Ben Sommeijer (MAS1): Phytoplankton dynamica  Blauwalgen in het Ijsselmeer Modelleren planktonconcentraties in het Nieuwe Meer (Amsterdam ZO) Simulaties, hydrodynamica en ecologie

14 Arjen Doelman (MAS1): `Pattern Formation’  Verwoestijning Niger, Afrika; schaal: tientallen meters Vegetatiepatronen als indicatie voor verwoestijning

15 ANDERSOORTIGE ACTIVITEITEN: Het NISB = Netherlands Institute for Systems Biology Samenwerking tussen: &  17 december `kennismakingsdag’ op de werkvloer. Er loopt een wervingsactie voor twee bio-informatici en/of bio- mathematici op tenure track niveau. De `bio-bonus’.

16 Wiskunde heeft langere traditie/is meer geïntegreerd in AARD wetenschappen AARD wetenschappen `continue’ wiskunde  MAS LEVEN swetenschappen zijn nog op zoek naar `fundamentele wetten’ Wiskunde/Informatica? LEVEN swetenschappen  INS, MAS, PNA LEVEN swetenschappen :Triviale W & I? Of juist veel te moeilijk?? AARD  LEVEN

17 PLANNEN & SYNERGIE Gecombineerde aanstellingen, detacheringen, gasten,... Frank Bruggeman (CWI & VU: NISB) – MAS3 Huib de Swart (IMAU, Institute for Marine and Atmospheric research Utrecht : NDNS) – MAS1... DIVERSITEIT & SYNERGIE: Duidelijk aanwezig binnen de Aardwetenschappen (  MAS) Binnen de Levenswetenschappen? AARD & LEVEN (phytoplankton, verwoestijning,...) Een gecombineerde krachtsinspanning? Klimaat? `Genetics’? Kankeronderzoek? Medisch-technisch?...