De presentatie wordt gedownload. Even geduld aub

De presentatie wordt gedownload. Even geduld aub

Master Bioinformatics (Bioinformatics & Systems Biolgy) Jaap HeringaSanne Abeln Anton Feenstra.

Verwante presentaties


Presentatie over: "Master Bioinformatics (Bioinformatics & Systems Biolgy) Jaap HeringaSanne Abeln Anton Feenstra."— Transcript van de presentatie:

1 Master Bioinformatics (Bioinformatics & Systems Biolgy) Jaap HeringaSanne Abeln Anton Feenstra

2

3 Van Gen naar Functie Genes mRNA Proteins TERTIARY STRUCTURE (fold)‏ Metabolites

4 next generation sequencing (baseclear) mammaprint (agendia) Onderzoek & Bioinformatica Model + Algorithme clinical trials (chdr)

5 Opbouw Studie - Keuze Major Bioinformatics Major Systems Biology

6 Wat is Systeem Biologie? Hoe zou jij erachter komen hoe een radio werkt? Hoe komt een bioloog erachter hoe een radio werkt? We zouden het systeem willen begrijpen.

7 Wat is Systeem Biologie?

8 Wie komen studeren? BiologieInformaticaBioinformatica Master Bioinformatica Leer samenwerken met mensen uit verschillende disciplines WOHBO

9 Opbouw Studie: vakken Vakken -4 vakken (24 ects) verplicht voor beide majors -3 vakken (18 ects) voor Bioinformatica -3 keuze vakken (18 ects) Stages -Totaal 60 ects

10 Opbouw Studie - Jaar 1 gezamenlijke start Bioinformatics & Systems Biology keuze moment gezamenlijk vak Bioinformatics

11 Opbouw Studie - Jaar 1

12 -door samenwerking is het programma goed “studeerbaar” in twee jaar. -Keuzevakken kunnen goed ingepland worden

13 Opbouw studie: Keuzevakken Systems Biology Basic models in Systems Biology Advanced models in Systems Biology Artificial Intelligence Data mining techniques Genetic algorithms Neural Networks Statistics Statistical Genetics Statistical Models Biology Epigenetics Molecular physiology Other interesting options Principles of Neuroscience Physical biology of the cell

14 Opbouw studie - Jaar 2 twee stages/afstudeervakken: Minor: ects Major: ects Stageplekken: Bedrijf, Universiteit, Buitenland, Instituut, Lab, Ziekenhuis

15 Stageplekken Nederland, onder andere: – VU (FEW/ FALW) – VUmc – CMBI – UMCU – UvA – UU – TNO – MRC-Holland – LUMC – Philips – Organon (Merck) – Agendia – Keygene – Baseclear

16 Stageplekken Buitenland: – Stockholm Bioinformatics Centre – European Bioinformatics Institute, Hinxton, UK – Deutsche Krebs Forchungs Zentrum, Heidelberg – European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg – INRIA Strasbourg – Sloan Kettering Foundation NYC, USA – LONI laboratory UCLA, USA – Oakland University, NZ – RIKEN Tokyo, Japan – UMC Mineapolis (Ann Arbour), USA

17 next generation sequencing (baseclear) mammaprint (agendia) Fundamentals of Bioinformatics Model + Algorithme clinical trials (chdr)

18 Intoduction to Systems Biology

19 Algorithms in Sequence Analysis HMMs Dynamic Programming Tree Building Alignment

20 Structural Bioinformatics ‘ab-initio’ prediction Analysing protein structures Homology modeling Protein Simulation

21 Bioinformatics for Translational Medicine Store, process, analyse, model, predict

22 Onderzoek in onze groep

23 Onderzoek in onze groep

24 Reversible oligomerization Irreversible fiber formation

25 Minor... (voor Bachelor).... komt eraan, waarschijnlijk in 2012/ /2012 – We stellen een vakkenpakket samen voor HBOers die kan dienen als minor

26 Waarom een Master? kritisch denken - nieuw vakgebied – zelf nieuwe methodes inschatten overzicht – Onderzoek, papers doorgroei in bedrijfsleven! – wat + hoe + waarom

27 Requirements Aantoonbare ervaring in (Moleculaire) biology of Computer Science HBO - Bioinformatica - geen extra eisen Verplicht intake gesprek Kleine deficiënties bijwerken tijdens master (< 12 ects): Bijv: biologie, programmeren, wiskunde, statistiek Individuele begeleiding in bioinformatica groep

28 Waarom Bioinformatica in Amsterdam? Master Bioinformatica titel Geaccrediteerd! Diepte in “Bioinformatica” Sterk in Internationaal Onderzoek Veel contacten (stages) Midden in nieuwste ontwikkelingen Interdisciplinair Karakter “Dicht bij” Systeem Biologie Studenten met verschillende achtergronden Persoonlijke mentoring (VU) – direct contact met docenten

29 Master Bioinformatics Jaap Heringa Sanne Abeln Anton Feenstra


Download ppt "Master Bioinformatics (Bioinformatics & Systems Biolgy) Jaap HeringaSanne Abeln Anton Feenstra."

Verwante presentaties


Ads door Google