De presentatie wordt gedownload. Even geduld aub

De presentatie wordt gedownload. Even geduld aub

Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie Historische ontwikkeling van de systematiek 5. Ontwikkelingen in de twintigste eeuw formele.

Verwante presentaties


Presentatie over: "Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie Historische ontwikkeling van de systematiek 5. Ontwikkelingen in de twintigste eeuw formele."— Transcript van de presentatie:

1 Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie Historische ontwikkeling van de systematiek 5. Ontwikkelingen in de twintigste eeuw formele analyse van taxonomische gegevens NUMERIEKE TAXONOMIE

2 vorm-systematiek: heuristiek

3 1. analysekenmerken 2. synthese→ taxa

4

5

6 analysekenmerken vorm van de cellen vorm en kleur van kolonies gram kleuring fysiologische eigenschappen biochemische tests synthesetaxa

7 R.Y. Stainier, M. Doudoroff & A.E. Adelberg (1970) The microbial world, ed. 3, p Prentice-Hall For most major biological groups [including the bacteria], the general course of evolution will probably never be known, and there is simply not enough evidence to base their classification on phylogenetic grounds. For these and other reasons, most modern taxonomists have explicitly abandoned the phylogenetic approach …

8 Robert R. Sokal ( ) & Peter H.A. Sneath ( ? - )

9 Sokal & Sneath 1963 Principles of Numerical Taxonomy Sneath & Sokal 1973 ed. 2 “One reason the book has been so widely cited is that it was very comprehensive, covering all aspects of classification including nonbiological applications. It contained numerous formulae and descriptions of algorithms but was not too heavily mathematical. It also reviewed critically the voluminous literature of the preceding 10 years. PHA Sneath, Current Contents 1987

10 Caminalcules: 29 recent / 48 fossiel Sokal, R. R.; K. L. Fiala; G. Hart (December 1984). "OTU Stability and Factors Determining Taxonomic Stability: Examples from the Caminalcules and the Leptopodomorpha". Systematic Zoology 33 (4):

11 Numerieke taxonomie - beginselen kenmerken1. alleen homoloog 2. consistente analyse 3. ongewogen 4. zoveel mogelijk synthese1. fenetisch standpunt 2. wiskundig model * * meestal geometrisch model (multivariate analyse met bijvoorbeeld Euclidische afstand)

12 kenmerken1. alleen homoloog 2. consistente analyse 3. ongewogen 4. zoveel mogelijk synthese1. fenetisch standpunt 2. wiskundig model *

13 Kenmerk: huidschubben Homoloog??

14

15

16

17 kenmerken1. alleen homoloog 2. consistente analyse 3. ongewogen 4. zoveel mogelijk synthese1. fenetisch standpunt 2. wiskundig model *

18 alfa-taxonomie diairesis als oorzaak van inconsistente analyse

19 kenmerken1. alleen homoloog 2. consistente analyse 3. ongewogen 4. zoveel mogelijk synthese1. fenetisch standpunt 2. wiskundig model *

20 alfa-taxonomie gewogen kenmerken aantal poten > kleur van de beharing aantal cotylen > bladconsistentie

21 kenmerken1. alleen homoloog 2. consistente analyse 3. ongewogen 4. zoveel mogelijk synthese1. fenetisch standpunt 2. wiskundig model

22 kenmerken1. alleen homoloog 2. consistente analyse 3. ongewogen 4. zoveel mogelijk synthese1. fenetisch standpunt 2. wiskundig model

23 Werkwijze van de numerieke taxonomie 1.keuze studiegroep en OTU’s (operational taxonomic units) 2.analyse van zoveel mogelijk homologe kenmerken 3.codering kenmerken en hun toestanden - aan /afwezig - kwantitatieve meertoestandenkenmerken: standaardiseren - kwalitatieve meertoestandenkenmerken - probleem binnen-OTU variatie - probleem ontbrekende gegevens 4.rekenblad met ruwe gegevens 5.multivariate analyse: Systat, Statistica, NTSYSpc 6.taxonomische conclusies

24 Werkwijze van de numerieke taxonomie 1.keuze studiegroep en OTU’s (operational taxonomic units) 2.analyse van zoveel mogelijk homologe kenmerken 3.codering kenmerken en hun toestanden 4.rekenblad met ruwe gegevens 5.multivariate analyse: Systat, Statistica, NTSYSpc - euclidische afstand, Pearson … - clusteranalyse → dendrogram (fenogram) - PCA & aanverwante methoden 6.taxonomische conclusies

25


Download ppt "Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie Historische ontwikkeling van de systematiek 5. Ontwikkelingen in de twintigste eeuw formele."

Verwante presentaties


Ads door Google