Miriam Wetzels Medische Bibliotheek Atrium mc

Presentatie over: "Miriam Wetzels Medische Bibliotheek Atrium mc"— Transcript van de presentatie:

1 Miriam Wetzels Medische Bibliotheek Atrium mc
Zoeken in PubMed Het zoeken van de juiste informatie kan een regelrechte uitdaging zijn. Mijn doel is u via deze presentatie inzicht te geven in de mogelijkheden van PubMed waardoor u beter en gerichter informatie kunt zoeken. Ik hoop dat ik daarin slaag. Voor degene die nog meer wil weten over werken met PubMed: tutorial uitgebreide helpfunctie beschikbaar Van nieuwe zaken word je op de hoogte gehouden door: New/Noteworthy Miriam Wetzels Medische Bibliotheek Atrium mc Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

2 Log in met: medbib gasten 6-4-2017
Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

3 Overzicht presentatie
Overzicht presentatie Algemeen, schermen en hulpmiddelen Zoeken Single citation, clinical queries and systematic reviews, auteur, titel, MESH/onderwerp,vrije veld, tags gebruiken Zoekresultaten printen, bewaren, downloaden, mailen De presentatie is als volgt opgebouwd: zie Dia Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

4 PubMed Citaten: Uit meer dan 4000 tijdschriften
PubMed Citaten: Uit meer dan 4000 tijdschriften Gepubliceerd in meer dan 71 landen 11 miljoen records die teruggaan tot 1966 Maandelijks nieuwe artikelen - Het aanbod uit Nederlandstalige tijdschriften is beperkt. - Advies: zoek Nederlandstalige informatie in PiCarta PubMed is niet synoniem met Medline PubMed is iets uitgebreider (komt in volgende dia). Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

5 Records in PubMed 3 vormen:
Records in PubMed 3 vormen: in-process; record moet nog geïndexeerd worden met MESH-termen en andere informatie (type publicatie, leeftijdsgroep etc.) Ook PreMedline genoemd indexed for MEDLINE; alle gegevens zijn toegekend supplied by publisher; niet altijd volledig geïndexeerd Supplied by publisher: gaat het bv. om artikelen die elektronisch door de uitgever aan de NLM worden geleverd. De meeste, maar niet alle, artikelen worden geïndexeerd. Niet geïndexeerd: - artikelen die buiten aandachtsgebied vallen (bv. geologie e.d.) - tijdschriften die selectief geïndexeerd worden - en records die gepubliceerd zijn in nummers voordat het tijdschrift in Medline werd opgenomen. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

6 Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

7 Trefwoorden Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

8 Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

9 PreMedline “In-process citations”
PreMedline “In-process citations” Na toevoegen Mesh termen =>Medline Premedline-referenties in zoekresultaat opnemen: zoekactie via “free text” zoekwoorden Wanneer via de Mesh gezocht wordt, dat is de trefwoordenlijst waar ik op terugkom, dan mis je dus de artikelen die nog niet geïndexeerd zijn. Vaak is dat recent materiaal Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

10 Oldmedline 1.5 miljoen OLDMEDLINE citaten
Oldmedline 1.5 miljoen OLDMEDLINE citaten Artikelen uit internationale biomedische tijdschriften geneeskunde preklinische wetenschappen verwante gezondheids-wetenschappen Citaten uit papieren index Geen abstracts Publicatie-type = alleen “journal article” In 2004 verwachten ze ook toegevoegd te hebben Alleen zoeken in Oldmedline kan door via Limits bij Subsets: Oldmedline te kiezen. De indeling van de zoekvelden in de Oldmedline verschilt tussen de verschillende jaren en ook zijn nog niet alle records vanuit LOCATORplus overgezet. Er zijn veel uitzonderingen wat betreft het zoeken in OLDMEDLINE en wat betreft het werken met de gegevens hieruit. Voert in dit kader te ver om hier op door te gaan. Wie meer wil weten kan dit nalezen onder de optie Overview Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

11

12 Medische Bibliotheek Intranetsite
“Toegangspoort” voor medische literatuurbronnen

13 Verschillende inlogmogelijk- heden (allemaal gratis)
Verschillende inlogmogelijk- heden (allemaal gratis) PubMed alles query.fcgi PubMed Atrium = hele PubMed + extra iconen online + papieren collectie tijdschriften Atrium query.fcgi?holding=inlamclib_fft Om elektronische abonnementen te kunnen bekijken, dient u wel een password aan te vragen bij de bibliotheek Een verdere uitleg over hoe dat functioneert krijgt u wanneer u zich daarvoor aanmeldt. Vb. Circulation (gaat via IP) Archives of surgery (gaat via password) atrium De icoontjes worden getoond wanneer in DISPLAY de optie “Abstract” of “Citation” wordt aangeklikt. Niet-medewerkers Atrium kunnen niet inloggen op de elektronische abonnementen, wel kunnen ze zien welke abonnementen beschikbaar zijn en vanaf wanneer. LET OP: Niet alle uitgevers bieden de mogelijkheid om gegevens te koppelen. Wanneer er geen ATRIUM-aanduiding bij staat wil dat nog niet zeggen dat het tijdschrift niet aanwezig of niet elektronisch beschikbaar is. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

14 Zoekresultaat tonen Display menu biedt verschillende opties
Zoekresultaat tonen Display menu biedt verschillende opties Eén is onmisbaar: CITATION MESH-termen (indien geïndexeerd) Citaat + Abstract Icoon - aanwezig in bibliotheek Adres van eerste auteur De optie Citation biedt dus de mogelijkheid om MESH-termen + subheading te localiseren. Waarom dat een goed instrument is, is hopelijk aan het einde van mijn verhaal duidelijk. Om artikelen fulltext te kunnen bekijken is vaak een abonnement nodig of er wordt een vergoeding gevraagd, maar dat is niet altijd het geval: - icoon Atrium online - aanduiding “Free fulltext” (groen icoon, kom ik nog op terug). - tip: probeer het De * geeft aan dat het een major topic is. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

15 DISPLAY Via Citation: Abstract + icoontjes zichtbaar

16 Tijdschrift aanwezig in papieren collectie

17 Bezitsgegevens medische biblio-theek Atrium mc

18 Link Out Record kan link bevatten naar: Full text article
Link Out Record kan link bevatten naar: Full text article Andere databank Gedeelte uit tekstboeken Documentleverantieservice Een overzicht van de boeken is te vinden op de Hoofdzoekregel via Books Klik rechts op scherm met de linkermuisknop op de term “Links” vb. Chest [so] Heyligers via Index Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

19

20 Alleen zoeken in abonnementen Atrium
Alleen zoeken in abonnementen Atrium Inloggen via PubMed Atrium In zoekveld invullen: loprovinlamclib [filter] Levert alleen treffers op waarvan het tijdschrift in Atrium mc aanwezig is (print en/ of elektronisch) Zoekfilter combineren met trefwoord (bv. loprovinlamclib [filter] AND Arthroscopy [MeSH] (= beperking!)) Via PubMed Atrium + loprovinlamclib [filter] + measles [MESH] = ± 94 hits = duidelijk een beperking Zoekt u PubMed Atrium + measles [MESH] ± 8972 PubMed + measles [MESH] ook ± 8972 Dan ziet u dat er geen verschil is. PubMed Atrium voegt alleen de iconen toe: u krijgt niet meer of minder informatie. VOLGENDE DIA ZIT EEN LINK OM ALLEEN OP PUBMED IN TE LOGGEN. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

21 Ingelogd met Atrium iconen
Ingelogd met Atrium iconen Zoekfilter Combineren via “AND” (hoofdletters!) Trefwoord Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

22 Pubmed: alleen zoeken in tijdschriften die gratis online zijn
Pubmed: alleen zoeken in tijdschriften die gratis online zijn Inloggen op PubMed In vrije zoekveld intypen: loattrfree full-text [filter] of loattrfree full text [filter] of free full-text [sb] of free full text [sb] alle vier formules = zelfde resultaat Combineren met andere zoekvraag is mogelijk Loattrfree full-text [filter] + measles [MESH] = ± 184 Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

23 Icoontjes Wat betekenen ze?
Artikel inclusief abstract Artikel zonder abstract Artikel is gratis verkrijgbaar op internet Artikel is gratis verkrijgbaar via PubMed Central

24 Features Balk Limits: beperkt vraag tot specifieke velden: leeftijdsgroepen, geslacht, soort studie, publicatiedatum of invoerdatum, een specifieke taal of een subset (resultaat meer relevante vraag) Details: bekijken hoe de zoekstrategie door PubMed vertaald wordt (bv. breast cancer) + via Details: bewaren zoekvraag Via Limits kunnen inperkingen worden ingesteld op de volgende categorieën: afzonderlijke velden - aanwezigheid van een samenvatting publicatietypen taal leeftijdsgroepen mens/dier subset publicatie-datum geslacht Een of meer van deze inperkingcategorieën kunnen ingesteld worden. Binnen een categorie kan slechts één keuze gemaakt worden. Na zoeken met inperkingen staan op het referentie-scherm, in een gele balk, de ingestelde inperkingen aangegeven. Met een V voor de Limits-optie wordt aangegeven dat een of meer inperkingen ingesteld staan. Ze zijn alle in een keer te verwijderen door de V weg te klikken. Let op om de limieten te verwijderen bij een nieuwe zoekvraag!!! DENK ERAAN BIJ INSTELLEN LIMIETEN BEPERK JE HET ZOEKEN ALLEEN TOT DIE RECORDS DIE VOLLEDIG GEÏNDEXEERD ZIJN. TAALLIMIET WEL ALTIJD TOEPASBAAR De belangrijkste mogelijkheden zitten onder deze knop. Meer limieten onder: Preview/index (volgt nog). Details: Soms heb je misschien het idee dat PubMed de zoekvraag op een manier geïnterpreteerd heeft die je niet verwachtte. Via Details kun je je vraag bekijken Voorbeeld: funji OR (algae = woord fout + haakje niet Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

25 Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

26 Inperken op bijv.: taal, leeftijdsgroep, publicatietype etc.
Inperken op bijv.: taal, leeftijdsgroep, publicatietype etc. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

27 Let op: Verwijder de ingestelde limieten bij een nieuwe zoekvraag

28 Bekijk hoe PubMed de zoekstrategie vertaald heeft

29 PubMed toont zelf alternatief

30 History “History”: overzicht van de zoekstrategie en zoekresultaten. Niet bedoeld om de zoekvraag te bewaren! Zoekresultaten combineren of gebruiken met nieuwe zoekvragen Maximaal 100 zoekvragen (acht uur bewaard) PubMed plaatst een “zoeknummer” boven aan de “History” wanneer de nieuwe zoekvraag dezelfde is als een eerdere search “Clear History” button Niet bedoeld om de zoekvraag te bewaren. Hoe dat wel moet kom ik later in deze presentatie nog op terug Je bewaart de strategie wel, maar de zoekhistorie gaat na acht uur verloren. Alle nummers uit de zoekhistorie zijn weg of misschien vervangen door andere zoekvragen SINDS KORT BIEDT PUBMED DE MOGELIJKHEID OM OOK ÉÉN ENKELE ZOEKVRAAG TE VERWIJDEREN. LATEN ZIEN. Op die manier kun je ook vragen met elkaar combineren via de Booleaanse operatoren of de vraag bekijken via Details. Let er wel op dat veld leeg is of dat je de juiste termen met elkaar combineert. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

31

32 Preview/Index Alleen de laatste drie zoekvragen zijn bewaard
Preview/Index Alleen de laatste drie zoekvragen zijn bewaard Via “Index”: scannen en selecteren van zoektermen uit specifieke zoekvelden Deze optie biedt een aantal mogelijkheden om de zoekvraag op te bouwen. Gedeelte van de de mogelijkheden is hetzelfde als bij “History”, maar er zijn ook een aantal belangrijke verschillen (Button is 2x aanwezig) Via “Index” is het mogelijk om zoektermen uit specifieke zoekvelden te scannen en selecteren. Vb. Kiezen van een publicatie type dat niet in Limits staat (daar staan alleen de meest populaire) Kies PUBLICATIE TYPE uit Preview/Index scroll menu. Klik op button INDEX Kies gewenste publicatie type Combineren is mogelijk via AND, OR en NOT Met de CTRL-knop is het mogelijk om meer termen te kiezen Ook handig om een bv. een Taal aan te geven. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

33 Zoeken Bepaal de hoofdonderwerpen
Zoeken Bepaal de hoofdonderwerpen Kijk of alternatieve zoektermen nodig zijn (Dorland’s medical dictionary) Verfijn de zoekvraag; bv. door in te perken op jaren, studie-groep (bv. man-vrouw) Amerikaans/ Engelse spellingsvarianten Verbuigingen/ meervoud- enkelvoud Hoe gedetailleerd je wil zoeken, hangt waarschijnlijk ook af van het doel waarvoor je het nodig hebt. Soms volstaat bv. al een review artikel Ga je zelf een artikel schrijven of misschien wel promoveren dan zoek je veel diepgaander. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

34 Single Citation Matcher
Single Citation Matcher Eén enkele referentie opzoeken (vooral als de referentie onvolledig is; snelste methode: jaar - 1ste blz. - auteur) Ook handig om één goed artikel op te zoeken en via Related articles een set artikelen over hetzelfde onderwerp te vinden Related articles: Lijst door computer geselecteerd op grond van trefwoorden, titelwoorden e.d. - naar hun overeenkomst met de uitgangsreferentie. Deze uitgangsreferentie is steeds de eerste van de verwante referenties. Een opgeroepen lijst van Related Articles krijgt een setnummer, en kan desgewenst via Limits ingeperkt worden, bijvoorbeeld op taal of op publicatiedatum. Lijst wordt getoond in volgorde van relevantie. BIJ INVULLEN TIJDSCHRIFT: SPEL JE DE TITEL VERKEERD OF GEBRUIK JE VERKEERDE AFKORTING= resulaat is 0 Met heel weinig gegevens toch met relatief weinig moeite iets te vinden. TONEN Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

35 Zoek verwante artikelen
Zoek verwante artikelen Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

36

37 Clinical Queries and Systematic Reviews
Clinical Queries and Systematic Reviews Snelle, eenvoudige methode om een klinische vraag op te zoeken Gericht zoeken naar bepaald soort artikelen (domeinen genoemd: therapy, diagnosis, etiology, prognosis ). Keuze uit: uit sensitief zoeken of specifiek zoeken Zoeken naar systematic reviews, meta-analyses, reviews van clinical trials, evidence-based medicine, consensus development conferences en guidelines Zoeken naar verschillende topics op het gebied van medische genetica V.b Measles Nadeel: geen uitgebreide zoekmogelijkheid Voor bepaalde onderwerpen is het niet de beste keus b.v. “behandeling van schotwonden in de borst” levert niet veel artikelen op. Ongetwijfeld vanwege het ontbreken van een dubbelblind studie of een randomized controlled trial hierover Dus niet gebruiken voor een zorgvuldige,uitgebreide zoekvraag. Je moet nl. de onderliggende voorbedachte zoekstrategie accepteren. Wil je daar meer controle over hebben dan moet je een andere benadering kiezen. Nadruk ligt op best evidence Belangrijkste aspecten in de filter: Dubbelblind studie of een randomized controlled trial Vanuit de MESH is het mogelijk om de term toe te voegen aan Clinical queries, is ook mogelijk om termen aan de zoekregel toe te voegen met Booleaanse operatoren.Gebruik van subheadings en tags voor Major Topic en Do not explode zijn niet te gebruiken wanneer je deze menu optie gebruikt. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

38

39 Zoeken op auteur Achternaam + initialen
Zoeken op auteur Achternaam + initialen Automatisch trunceren op verschillende initialen Niet trunceren?: zet de naam tussen aanhalingstekens en gebruik de tag [au]: vb. "wheeler d" [au] Alleen op de achternaam zoeken, gebruik de [au] tag Persoonsnaam als onderwerp, gebruik de [ps] tag bv. Darwin [ps] Via de zoekbalk kan direct gezocht worden op auteur, bij voorkeur met de veldaanduiding [au]. Zonder veldaanduiding wordt meestal in All Fields gezocht; bij sommige auteursnamen (bijvoorbeeld Rabbit) wordt via het Automatic Term Mapping systeem op MeSH Terms en Text Word gezocht, hetgeen uiteraard niet de bedoeling was. Bij het zoeken naar artikelen OVER personen: voeg dan de tag [ps] toe B.v.: Darwin [ps] Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

40 Auteur Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

41 Zoeken in titel Start voor meer complexe zoekvraag
Zoeken in titel Start voor meer complexe zoekvraag Nadeel: strategie = niet uitgebreid Snel vinden van paar relevante artikelen Plaats achter elk titelwoord de tag [ti] Tip: manage* [ti] OR review [ti] OR trends [ti] OR current [ti] AND knee [ti] De titel dekt vaak de lading van het artikel. Gebruik woorden die redelijkerwijs in de titel te verwachten zijn. Maak gebruik van truncatie en synoniemen. Is een opstap voor zoeken in Mesh Pas op met het toepassen van “Limits”; bij veel opties sluit je de nog niet geïndexeerde titels uit. Tip: Op zoek naar een zeer recent overzichtsartikel over een bepaald onderwerp? Misschien geïnteresseerd in citaten die nog niet geïndexeerd zijn + publicatietype “Review”? Probeer een zoekvraag in de titel te doen die het onderwerp combineert met termen zoals “management”, “review”, “trends”, “current” etc. TONEN Vb. Mogelijke complicaties voor arthroscopy van de knie Limiet: title, taal= engels + vanaf 1995 De relevante artikelen vormen de kern voor een aanvullende vraag. Zoek via DISPLAY Citation naar trefwoorden. Gebruik evt. de link Related articles. VERGEET NIET DE LIMIETEN TE VERWIJDEREN BIJ VOLGENDE ZOEKVRAAG Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

42 [ti]: woord wordt alleen in titel gezocht

43 Complexe zoekvraag Splits een uitgebreide zoekvraag
Complexe zoekvraag Splits een uitgebreide zoekvraag in een aantal losse onderdelen : Behoud van overzicht Losse termen makkelijk onderling combineren Start via de MESH In PubMed kan op veel verschillende manieren gezocht worden, van eenvoudig tot zeer geavanceerd. Met de Mesh wordt Medline grondig doorzocht. TONEN Bv. Measles Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

44 Zoek met tref- woorden =
MESH Database

45 MESH (Medical Subject Headings)
MESH (Medical Subject Headings) ± Mesh termen - Automa-tische lijst - Definitie van de zoekterm - Term goed gekozen? Spelling correct? Hiërarchische structuur (evt. “exploden”) Uniformiteit en consistentie in zoektermen Zonder MESH zou je moeten zoeken naar synoniemen. Vb.: renal stones - kidney stones - renal calculi - nephrolithiases De MESH geeft aan: kidney calculi Elke term die je zoekt: zoek die via de MESH op en voeg deze toe aan de zoekstrategie. Dat kan in één sessie, maar je kunt de vraag ook in stukjes hakken waardoor je de termen onderling ook makkelijker kunt combineren (VOORKEUR) Nadelen: - zoeken is ingewikkelder - zoeken kost meer tijd dan bij andere strategieën - sommige citaten - staat nog geen MESH-term bij - indexeren is mensenwerk waardoor citaten gemist kunnen worden Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

46 Kies hoofdterm + subheading

47 MESH term in de boom-structuur

48 Stuur de term naar de Search box

49 Klik op “Search PubMed” om de term te laten zoeken

50 MESH (Vervolg) Zoekresultaat kent hoge relevantie
MESH (Vervolg) Zoekresultaat kent hoge relevantie Introductiedatum MESH-term (vb. SARS, adenovirus) Via MESH: Automatische lijst van mogelijke termen Selecteer de term om de zoekvraag uit te voeren Via “Detailed Display”: Mesh Terms inperken tot Major Topic, evt. “Subheadings” toevoegen INTRODUCTIE DATUM betekent: pas vanaf dan een Mesh-term, voor die datum dus ook niet zoeken. TONEN Spelling correct? Typ in Mesh in: Pachydermoperiostose moet via MESH zijn: Pachydermoperiostoses en vervolgens komt er een hele andere zoekterm waar het wel onder valt. Vb. 2 : Wet lungs wordt automatisch omgezet in: pulmonary edema MESH-zoeken in combinatie met in vrije veld zoeken kan ook nog de niet geïndexeerde of inconsequent geïndexeerde titels opleveren Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

51 Via MESH: Automatische lijst van mogelijke termen

52 MESH -> gebruikt: Wanneer de zoekstrategie meer moet opleveren dan “geef me snel 1 of 2 goede citaten” Wanneer zoeken in “vrije veld” teveel resultaten oplevert Wanneer zoeken in “vrije veld” niet die precisie oplevert die nodig is Voorkeur van bibliotheek voor begin zoekvraag Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

53 Zoekvraag kleiner maken
Zoekvraag kleiner maken Subheadings toevoegen aan de MESH-term (82 verschillende) Inperken op leeftijdsgroep (via “Limits” of “Mesh”) De aard van de studies: bv. human vs. animal, male vs. female (via Limits en via Mesh) Publicatie type: bv. Clinical Trials, Editorial, Review (via Limits en via Mesh) LET OP: Nieuwe zoekvraag? Verwijder dan de gekozen limiteringen Subheadings: TONEN measles + diagnosis 1x via MESH en 1x via vrije veld twee voorbeelden noemen: aspirin + therapeutic use, adverse effects Leeftijdsgroep: Bekijken via MESH “Age groups” TONEN Wijs dan ook even op Child, infant en newborn waarbij ook overkoepelende categorie bestaat van All infant birth-23 mnd All child 0-18 jaar All adult 19+ Via Limits is onder subsets mogelijk om de zoekvraag kleiner te maken: vb. CORE CLINICAL JOURNALS -> limiteert de zoekvraag en er wordt alleen gezocht in ± 120 medische tijdschriften met een hoge impactfactor Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

54 LET OP Inperken op referenties met samenvatting: voor 1975: geen samenvattingen toegevoegd. vanaf 1975: in toenemende mate nu: samenvatting beschikbaar =>als beschreven artikel Engelstalige samenvatting bezit Inperken op publicatietypen, leeftijden, geslacht en mens/dier betekent tevens een inperking tot alleen Medline-ref. PreMedline-referenties, de meest recente PubMed-referenties worden automatisch uitgesloten, aangezien zij nog niet volledig geïndexeerd zijn en de genoemde inperkingscategoreën niet bezitten IN ANDERE BEWOORDFINGEN VOOR PUNT 3: Records in process of Records supplied by publisher worden niet meegenomen. Wil je toch zoeken naar een review artikel in de nog niet geïndexeerde artikelen dan is daar een foefje voor: vb. Vraag 1 ARDS [TI] OR adult respiratory distress [TI] AND review [TI] OR overview [TI] OR current [TI] Vraag 2 Respiratory distress syndrome, adult [MESH] AND review [PT] Combineer vraag 1 en 2 met OR Dan is het mogelijk om een taal limiet toe te voegen, werkt voor beide indexed en not-indexed. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

55 MESH (niets gevonden?) Zoek dan in vrije veld Niet precies
MESH (niets gevonden?) Zoek dan in vrije veld Niet precies Synoniemen en woordvarianten belangrijk Kijk vervolgens in het MESH- veld om trefwoorden te zoeken (via Display: Citation) Bouw de vraag opnieuw op via de MESH database - grote probleem is dat het niet “precies” is - je moet ook aan synoniemen denken: bv. STONE of CALCULI - vb. van een “misser” in het vrije veld: Invloed van koude temperatuur op ischemic heart disease. Vraag: COLD AND ISCHEMIC HEART DISEASE Via DETAILS: resultaat ietwat verrassend: De term COLD is correct vertaald naar COLD (temperatuur) maar ook naar COMMON COLD en LUNG DISEASES, OBSTRUCTIVE. In het DETAILS scherm kun je de vraag aanpassen en weghalen wat je niet nodig hebt. LAAT VIA DE CITATION OF MEDLINE PRESENTATIE ZIEN DAT JE DAAR DE TREFWOORDEN KUNT BEKIJKEN. Funji OR (algae Een goed geconstrueerde vraag in het “vrije” veld kan records opsporen die anders gemist worden: bv. record dat nog in process is of term die niet goed geïndexeerd is door de Medline indexers. In process betekent: MESH-termen moeten nog gegeven worden en bv. publicatie type en leeftijdsgroepen. De basis bibliografische gegevens zijn beschikbaar om in te zoeken. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

56 Zoeken in vrije veld Zoekterm in vrije veld?
Zoeken in vrije veld Zoekterm in vrije veld? Pubmed zet via “Automatic mapping” de zoekterm om in geschikte PubMed-term (o.a. Mesh, maar ook free text!) Free text: enige zoekmogelijkheid voor PreMedline en kan ook (aanvullend) resultaat opleveren in Medline Controleer via DETAILS of PubMed de vraag juist vertaald heeft o.a. Mesh Term in zoekactie opgenomen? Werkt als volgt: computer gaat na of zoektermen overeenkomen met (verwijzingen naar) Mesh Terms als dat het geval is, wordt op die Mesh terms gezocht, en bovendien nog op de zoektermen als Text Word (free text woord in o.a. titel, samenvatting) als geen Mesh Terms worden gevonden, worden de ingetypte zoektermen in All Fields (free text in alle velden) gezocht. Je bent dan afhankelijk van het feit of gezochte woorden in de titel of het abstract staan Deze strategie wordt Automatic mapping genoemd en is vaak, alhoewel niet altijd, verrassend succesvol. Vb. Kidney stones - dat wordt naar Mesh gemapped als Kidney calculi. Dit is een tamelijk gecompliceerd proces. Wanneer je weet hoe het werkt, geeft dat een beter inzicht hoe Pubmed een vrije veld vraag interpreteert, maar dat voert hier te ver.. Kijk echter altijd via DETAILS of je vraag wel zo vertaald is als ook je bedoeling was. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

57 Voorbeelden van zoek-woorden en zoekacties
Voorbeelden van zoek-woorden en zoekacties Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

58 Tags Tag achter de te zoeken term plaatsen, gebruik deze optie in “vrije veld” Tags weergeven met [ ] Niet hoofdlettergevoelig Meer weten?: PubMed Help functie (Search field qualification) Voor meer tags: SearchFieldDescriptionsandTags (aan elkaar vast typen) Gebruik van Tags is soms sneller en efficiënter. Voorbeelden voor het gebruik van Tags volgen op de volgende dia. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

59 Tags 6-4-2017 Let op: Bij gebruik van titelwoorden en tekstwoorden:
achter elk woord de tag plaatsen anders maakt Pubmed er een zin van en plaatst hij de twee woorden achter elkaar. Wanneer hij de zin vervolgens niet herkent, is het zoekresultaat 0/nul Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

60 Journals database Zoeken op tijdschrift
Journals database Zoeken op tijdschrift Kruis de box links aan om het tijdschrift te markeren Klik aan de rechterkant op "Links" met de linkermuisknop om aan te geven dat het tijdschrift in Pubmed gezocht moet worden Vb. Lancet Wanneer een titel van een tijdschrift speciale karakters bevat, haakjes bv. dan moet je de naam intypen zonder deze haakjes Bv. J.Hand Surg [Am] wordt J Hand Surg Am Inmiddels is het ook mogelijk om het tijdschrift niet alleen naar Pubmed te verplaatsen maar kun je ook aangeven dat de titel direct naar de single citation matcher verplaatst moet worden. Ook het combineren van een aantal tijdschriften met OR en dan verzenden naar PubMed is mogelijk. Zo vergemakkelijk je de taak om een zoekvraag te beperken tot een specifieke groep tijdschriften. Voeg met SEND TO steeds een tijdschrift toe aan de zoekbox met OR. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

61 Stuur de term naar de Search box of geef opdracht via de optie “Links”
Vink keuze aan

62 Trunceren Voorzichtig met trunceren
Trunceren Voorzichtig met trunceren Trunceren zet "automatic mapping" en het automatisch "exploden" van Mesh-termen uit Wanneer je de "Mesh-methode" hanteert kom je dit “probleem” niet tegen Voorzichtig met een term tussen “ “ te zetten Voor het free text zoeken (met name belangrijk voor PreMedline) is trunceren heel nuttig. Echter, op getrunceerde zoekwoorden wordt het systeem van Automatic Term Mapping niet toegepast, waardoor geen vertaling naar MeSH Terms plaatsvindt en ook geen exploden van termen. Om te profiteren van zowel Automatic Term Mapping als truncatie kan de OR-combinatie van een wel en een niet getrunceerd zoekwoord getypt worden. Voorbeeld: coumarins OR coumarin*, Let wel op of er werkelijk een MeSH Term in de zoekactie wordt opgenomen! Via DETAILS Als meer dan 150 termen aan een truncatie voldoen, wordt alleen op de eerste 150 termen gezocht. Op het scherm verschijnt een waarschuwing in een roze balk Voorzichtig ook met een term tussen “ “ (haakjes) zetten. Zonder op details in te gaan als de term niet herkend wordt in bepaalde indexen zoekt PubMed verder maar in engere Mesh-termen wordt dan niet gezocht vanwege die haakjes. Uiteindelijk plaatst hij er zelf AND tussen. Check via Details hoe de vraag uitgevoerd is. Vb. “knee review” Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

63 Werken met de zoekresultaten
Werken met de zoekresultaten Booleaanse operatoren (AND, OR en NOT) altijd in hoofdletters!! Booleaanse operatoren worden in de meeste systemen van links naar rechts verwerkt Records downloaden in bibliogra-fische management software (bv. End Note, Reference manager, Procite): gebruik het MEDLINE formaat Om zoektermen te combineren, maak je gebruik van Booleaanse operatoren. Let erop dat je ALTIJD hoofdletters gebruikt. Gebruik je kleine letters dan krijg je geen resultaat of een hele vreemde uitkomst Vul je niets in dan wordt altijd aangenomen dat je “AND” bedoelt. Het is echter wel overzichtelijker om het erbij te zetten wanneer je AND bedoelt omdat Pubmed twee termen die naast elkaar staan in sommige gevallen ook als een zin opvat. Kijk weer via DETAILS of je krijgt wat je verwacht had. Let er ook op: Booleaanse operatoren worden in de meeste systemen van links naar rechts verwerkt. Een slecht ontworpen zoekvraag kan zo leiden tot misleidende, niet correcte resultaten: vb.: aspirin AND heart attack OR myocardial infarction 1e uitgevoerd: Aspirin AND heart attack. Het resultaat hiervan wordt met OR gecombineerd met myocardial infarction waarbij de dubbele resultaten eruit gehaald worden. Niet wat je verwacht had: Beter resultaat: heart attack OR myocardial infarction AND aspirin. Zelf splits ik de zoekvraag altijd in 2 (of 3) stukken dan voorkom je dit soort problemen en de resultaten zijn later in de zoekvraag ook weer te combineren. Ook mogelijk om de vraag tussen haakjes te zetten. De meeste zoeksystemen voeren eerst de vraag uit die tussen haakjes staat: aspirin AND (heart attack OR myocardial infarction) SPLITS DE VRAAG= MEEST OVERZICHTELIJKE Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

64 Kies hier optie “File” Formaat

65 Clipboard Verzamelen van geselecteerde referenties uit verschillende zoekvragen Toevoegen aan Clipboard (Kruis de box links voor de referenties aan), verander de optie bij de SEND TO in “Clipboard” en klik Een referentie toegevoegd aan Clipboard verandert van kleur (groen) 500 referenties (bij klik op SEND TO Clipboard zonder een keuze wordt de hele informatie naar het Clipboard gestuurd) Dubbele citaten worden verwijderd Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

66 Meer dan 20 records? Pas het getal in “Show” aan

67 Save Button Literatuuropgaven bewaren - Limiet is 10.000 items
Save Button Literatuuropgaven bewaren - Limiet is items Kruis de box voor de referenties aan Kies uit Display pull-down menu een formaat Kies uit SEND TO pull-down menu de optie "File” Venster - pad aangeven - naam geven aan het te bewaren bestand In Word is het bestand weer in te lezen (denk aan kiezen Medline formaat voor inlezen in bibliografische software) Bewaar citaat met de extensie “.txt” Bewaar een citaat met de extensie “.txt” dus jama.txt De veldaanduiding die in MEDLINE gebruikt wordt is nodig het resultaat te kunnen inlezen in bibliografische software. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

68 Let op Formaat Om te bewaren kies: Send to: File

69 Text Button Kies in het DISPLAY pull down menu het gewenste formaat
Text Button Kies in het DISPLAY pull down menu het gewenste formaat Kruis bij SHOW een getal aan dat hoger is dan het aantal te printen records Klik op SEND TO: Text om gevonden items in "platte tekst" weer te geven (zuiniger printen, geen kleurenprint) Laatste optie: spaart veel papier bij printen en levert tevens een goed afdrukresultaat op, d.w.z. dat aan de rechterkant geen letters wegvallen. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

70 Formaat Kies hier: Send to: Text Aantal

71 1: Xiong CZ, Hao JM. Spiral CT arthrography of multiplanar reconstruction and virtual arthroscopy technique in diagnosis of knee with internal derangements. Chin J Traumatol Apr;7(2): PMID: [PubMed - indexed for MEDLINE] 2: Hultin J. [Arthroscopy with local anesthesia a reality now?] Lakartidningen Jun 24;101(26-27):2290. Swedish. No abstract available. PMID: [PubMed - indexed for MEDLINE] 3: Bruun JV. [Arthroscopy, deep infection and results statement] Ugeskr Laeger Jun 7;166(24):2371; author reply Danish. No abstract available. PMID: [PubMed - indexed for MEDLINE]

72 ZOEKVRAAG BEWAREN Via Details
ZOEKVRAAG BEWAREN Via Details Zoekopdracht via Mesh database Resultaten staan op het scherm Klik op Details in de PubMed werkbalk Klik op de URL-button Sla de URL op in je favorieten Oproepen van bookmark leidt tot oproepen zoekstrategie Let op: NIET de URL opslaan die bij een "gewone" zoekvraag getoond wordt - verwijst nl. naar de plaats in de search-history - gaat na acht uur verloren Bij voortdurende interesse in een medisch onderwerp kan het bewaren van de zoekvraag van grote waarde zijn. Het is slechts mogelijk afzonderlijke sets op te slaan: één set per URL. In deze sets mogen geen setnummers verwerkt zijn. Voor het opslaan van zoekstrategieën dient dus een strategie in één keer te worden ingetypt, of stap voor stap, steeds voortbordurend op de voorafgaande stap, te worden opgebouwd. Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

73 Zoekvraag

74 Deze URL NIET gebruiken
Deze URL NIET gebruiken Gebruik deze optie om de URL te bewaren Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

75 Sla de URL op in “Favorieten”

76 ZOEKVRAAG BEWAREN Via My NCBI
ZOEKVRAAG BEWAREN Via My NCBI Registreren (cookies accep-teren) + user name GOED bewaren Zoekvraag bewaren via: - “Save search” (gebruik set-nummers mogelijk; geef logische naam) - Tabblad “History” - “Options” - “Save in my NCBI” Met optie voor een automatische update + mailen van zoekresul-taten uit bewaarde zoekacties Dewever atriummc Het is mogelijk om: - te zoeken op nieuwe citaten die toegevoegd zijn aan Pubmed sinds de laatste zoekvraag - de zoekvraag helemaal uit te voeren - 100 zoekvragen te bewaren per username Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels

77

78 Setnummer aanklikken en linker muisknop gebruiken

79 MY NCBI + Filters Inloggen Aanpassen algemene filters via icoon
Filter toevoegen voor: “Medische bibliotheek Atrium mc” (via “Browse” - “Libraries”) Via “Browse” - “Properties” nog veel meer individuele instellingen (bv. Nursing Journals)

80 Laat alleen de artikelen zien die gratis via internet verkrijgbaar zijn
Filters aan-passen Laat alleen artikelen zien die aanwezig zijn in Med. Bibl. Atrium (elektronisch of papier)

81 Searching is generally an iterative process if one strategy does not work, try another Of schakel de hulp in van een bibliothecaris Medische bibliotheek Atrium mc / Miriam Wetzels