Download de presentatie
De presentatie wordt gedownload. Even geduld aub
1
Master Bioinformatics
(Bioinformatics & Systems Biolgy) Jaap Heringa Sanne Abeln Anton Feenstra
2
Big Ban of biological data
3
Van Gen naar Functie Genes mRNA Proteins Metabolites
TERTIARY STRUCTURE (fold) Metabolites
4
Onderzoek & Bioinformatica
clinical trials (chdr) Model + Algorithme Wat gebeurt is nu de trends in het onderzoek, het analyseren en voorspellen met data van Wees niet bang dat je geen baan krijgt! next generation sequencing (baseclear) mammaprint (agendia)
5
Opbouw Studie - Keuze Major Bioinformatics Major Systems Biology
6
Wat is Systeem Biologie?
Hoe zou jij erachter komen hoe een radio werkt? Hoe komt een bioloog erachter hoe een radio werkt? We zouden het systeem willen begrijpen.
7
Wat is Systeem Biologie?
8
Wie komen studeren? Biologie Informatica Bioinformatica
WO HBO Biologie Informatica Bioinformatica Master Bioinformatica Leer samenwerken met mensen uit verschillende disciplines
9
Opbouw Studie: vakken Vakken
4 vakken (24 ects) verplicht voor beide majors 3 vakken (18 ects) voor Bioinformatica 3 keuze vakken (18 ects) Stages Totaal 60 ects
10
Opbouw Studie - Jaar 1 gezamenlijk vak gezamenlijke start
Bioinformatics & Systems Biology keuze moment Bioinformatics
11
Opbouw Studie - Jaar 1
12
Opbouw Studie - Jaar 1 door samenwerking is het programma goed “studeerbaar” in twee jaar. Keuzevakken kunnen goed ingepland worden
13
Opbouw studie: Keuzevakken
Systems Biology Basic models in Systems Biology Advanced models in Systems Biology Artificial Intelligence Data mining techniques Genetic algorithms Neural Networks Statistics Statistical Genetics Statistical Models Biology Epigenetics Molecular physiology Other interesting options Principles of Neuroscience Physical biology of the cell
14
Opbouw studie - Jaar 2 twee stages/afstudeervakken: Stageplekken:
Minor: ects Major: ects Stageplekken: Bedrijf, Universiteit, Buitenland, Instituut, Lab, Ziekenhuis
15
Stageplekken Nederland, onder andere: VU (FEW/ FALW) VUmc LUMC CMBI
UMCU UvA UU TNO MRC-Holland LUMC Philips Organon (Merck) Agendia Keygene Baseclear
16
Stageplekken Buitenland: Stockholm Bioinformatics Centre
European Bioinformatics Institute, Hinxton, UK Deutsche Krebs Forchungs Zentrum, Heidelberg European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg INRIA Strasbourg Sloan Kettering Foundation NYC, USA LONI laboratory UCLA, USA Oakland University, NZ RIKEN Tokyo, Japan UMC Mineapolis (Ann Arbour), USA
17
Fundamentals of Bioinformatics
clinical trials (chdr) Model + Algorithme next generation sequencing (baseclear) mammaprint (agendia)
18
Intoduction to Systems Biology
19
Algorithms in Sequence Analysis
Dynamic Programming HMMs Alignment Tree Building
20
Structural Bioinformatics
Analysing protein structures Homology modeling ‘ab-initio’ prediction Protein Simulation
21
Bioinformatics for Translational Medicine
Store, process, analyse, model, predict Combine exisitng knowledge, with patient data on expression and gene profile, and survival rate data, to make diagnonsis and understand disease.
22
Onderzoek in onze groep
23
Onderzoek in onze groep
24
Onderzoek in onze groep
Reversible oligomerization Irreversible fiber formation
25
Minor ... (voor Bachelor) .... komt eraan, waarschijnlijk in 2012/2013
2011/2012 We stellen een vakkenpakket samen voor HBOers die kan dienen als minor
26
Waarom een Master? kritisch denken - nieuw vakgebied overzicht
zelf nieuwe methodes inschatten overzicht Onderzoek, papers doorgroei in bedrijfsleven! wat + hoe + waarom
27
Requirements HBO - Bioinformatica - geen extra eisen
Aantoonbare ervaring in (Moleculaire) biology of Computer Science HBO - Bioinformatica - geen extra eisen Verplicht intake gesprek Kleine deficiënties bijwerken tijdens master (< 12 ects): Bijv: biologie, programmeren, wiskunde, statistiek Individuele begeleiding in bioinformatica groep
28
Waarom Bioinformatica in Amsterdam?
Master Bioinformatica titel Geaccrediteerd! Diepte in “Bioinformatica” Sterk in Internationaal Onderzoek Veel contacten (stages) Midden in nieuwste ontwikkelingen Interdisciplinair Karakter “Dicht bij” Systeem Biologie Studenten met verschillende achtergronden Persoonlijke mentoring (VU) direct contact met docenten
29
Master Bioinformatics
Jaap Heringa Sanne Abeln Anton Feenstra
Verwante presentaties
© 2024 SlidePlayer.nl Inc.
All rights reserved.