Genoomfokwaarden Samenvatting.

Presentatie over: "Genoomfokwaarden Samenvatting."— Transcript van de presentatie:

1 Genoomfokwaarden Samenvatting

2 Wat heb je geleerd? In traditionele fokkerij is nakomelingenonderzoek nodig om nauwkeurige fokwaarden te krijgen Alleen hengsten krijgen voldoende nakomelingen voor goede fokwaarden Hengstenselectie is dus bepalend voor vooruitgang in een stamboek Is de fokwaarde voor alle dieren gelijk, en op elke leeftijd. De SNP-effecten worden geschat uit een referentiepopulatie De nauwkeurigheid van de genomische fokwaarde wordt o.a. bepaald door de grootte van de gebruikte referentiepopulatie.

3 Wat heb je geleerd? We kunnen SNP-merkers aan de fokwaardeschatting toevoegen om deze nauwkeuriger te maken . Dit wordt wel Merker Ondersteunde Selectie genoemd (Engels, Marker Assisted Selection). Genotypering kan op elke leeftijd uitgevoerd worden, dus SNP-merkers kunnen op elke leeftijd gebruikt worden Als we heel veel SNPs hebben, waarmee we het hele genoom beslaan, (en we kennen hun effecten), dan kan op basis daarvan een fokwaarde worden gemaakt. Zonder gebruik te maken van fenotypes Dit is de essentie van Genomische Selectie

4 Wat heb je geleerd? Als we heel veel SNPs hebben (enkele duizenden), waarmee we het hele genoom aflezen, dan kan op basis daarvan een fokwaarde worden gemaakt. Zonder gebruik te maken van fenotypes Dit is de essentie van Genoom Selectie Voordelen van Genoom Selectie: Fokwaarden zijn veel eerder beschikbaar (niet meer wachten op nakomelingentest) Alle paarden in het stamboek hebben een nauwkeurige fokwaarde Onafhankelijk van fenotype (duur, geslachtsgebonden, leeftijd, challenge)

5 Wat heb je geleerd? Voorwaarde voor gebruik merkers in selectie
De effecten van de merkers op het kenmerk moeten geschat zijn Daarvoor is een referentiepopulatie nodig, met paarden waarvan genotypen en fenotypen bekend zijn De nauwkeurigheid van genoomfokwaarde wordt bepaald door de omvang van de referentiepopulatie en door de erfelijkheidsgraad (h2) van het kenmerk

6 Genoomfokwaarde In deze video legt Mario Calus van Wageningen University uit hoe een genoomfokwaarde tot stand komt