A. van Lieshout F. Stolwijk begeleider Dr. M. Somers
Leren Onderzoeken 1 ◦ Beeldvorming wetenschap ◦ Ervaring onderzoeken ◦ Andere leermethode
1.Inhoudsopgave 2.Algemene informatie 3.Intramoleculaire krachten 4.Intermoleculaire krachten I. Coulomb II. Lennard-Jones III. Morse 5.Ons onderzoek I. Vorig onderzoek II. Spartan III. Excel IV. Classical 6.Resultaten 7.Discussie
Binnen het watermolecuul ◦ Harmonische strek (l 1 ) ◦ Harmonische buig (θ) ◦ Lennard-Jones veld (σ)
In rood de Lennard-Jones Interactie In blauw de Morse Interactie In groen de Coulomb Interacties
Coulomb ◦ Interactie afhankelijk van de lading van de deeltjes en de afstand tussen de deeltjes.
Lennard-Jones-interactie Interactie afhankelijk van de afstand tussen de deeltjes.
Morse-interactie ◦ De dissociatie-energie is afhankelijk van de afstand tussen de moleculen. ◦ α, r e, D e parameters bepalen de curve
Voor elk molecuul kan via klassieke dynamica op tijdstip t worden berekend: =Snelheid =Acceleratie =Moment =Kinetische Energie =Positie (x,y,z) Hierbij worden de volgende formules gebruikt:
Doel vorig onderzoek ◦ Onderzoek waarom het HCl-molecuul niet dissocieerde en een verandering (verbetering) aanbrengen in de D e parameter. Ref1
Spartan ◦ 3 H 2 O + HCl ◦ Afstand meten (Å) ◦ Hoeken meten ◦ MP2, 631+G* Ref2
Least square diff. ◦ Σ= ◦ Newton root solver ◦ Zoekt minimale Σ Fitten ◦ Via verschillende route ◦ Gebruikt l.s.diff ◦ Data, spreiding ◦ Constrains
Excel ◦ Excel-sheet macro’s invoeren en formules invoeren voor de molecuul interacties ◦ Grafiek morse invoeren ◦ Afstanden invoeren ◦ Potentiaal fitten
▸ Classical º 20 H 2 O+HCl visualisatie º Script voor het model Ref3
Oude parameters: α=3.424 R e =2.43 D e =0.163 Nieuwe parameters: α=0.5 R e = D e = Calculated Σ:
Oude parameters Nieuwe parameters
Conclusie Nieuwe parameters zorgen dat HCl in water wel dissocieert; D e en α veranderden
Het werken in Excel, niet geavanceerd De “box” waarin de moleculen zaten was te klein waardoor (7%) energie afgekapt werd. Groter box, meer moleculen Meer geavanceerd programma voor fitten
Ref1: Gelauff, L., Götz, R., v. Meer, R., v. Paridon, J., Rooimans, K., Stoffelsma, C. Dissociatie van HCl in water (2006), blz 17 geraadpleegd op 6mei2008 Ref2: Chemical Physics letters Volume 325, issues 5-6, 4aug2000, blz geraadpleegd op 6mei2008 Ref3: Ferguson: D. Ferguson, J. Comput. Chem., 16 (1995) 501. SPC & SPC/E: H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. von Gunsteren, J. Hermans, Intermolecular Forces, B. Pullman ed., Reidel: Dordrecht, Holland, 1981, geraadpleegd op 14mei2008
Zijn er nog vragen over dit onderzoek?