Vraag 1: Ensembl – Humane actine Welke types informatie worden er gevonden naast gen informatie. Ensembl: www.ensembl.org.

Slides:



Advertisements
Verwante presentaties
Waarom DNA alleen niet genoeg is…
Advertisements

LLBA Zoeken op auteur met samengestelde naam Universiteitsbibliotheek verder = klikken.
Genregulatie en Epigenetica.
DNA Korte herhaling.
Hoofdstuk 3: DNA Eiwitten zijn belangrijk als bouwstof en het regelen van processen. In DNA zit de informatie voor het maken van eiwitten. DNA kan gebruikt.
Dihybride kruisingen.
Voorkennistoets Bio-informatica week 3.1.
Toetskwaliteit LAW onderwijsmiddag Leendert van Gastel, Amstel Instituut 24 mei 2005.
Bioinformatica: Leven in de computer.
Eiwitsynthese Klik hierop Klik hierop 1 uur 2 uur Jaak Smeets.
1 van genotype tot fenotype
Mayer-Rokitansky-Küster (-Hauser) syndroom genetische aspecten
In deze presentatie ga je kijken hoe van aanwijzingen van het DNA
Effecten mutaties Vervangen: Een te kort eiwit door een extra stopcodon. Leidt tot het vervangen van een aminozuur op een essentiële plaats. Verwijderen.
EIWITSYNTHESE.
ATLA Religion Database + ATLAS Zoeken naar en in ATLAS full-text artikelen Klikken = verder gaan.
ATLA Religion Database + ATLAS Zoeken op onderwerp met behulp van de index Klikken = verder gaan.
de erfelijke blauwdruk
Transcriptie DNA overschrijven.
1 van genotype tot fenotype
Hoofdstuk 10 : Van DNA tot eiwit
eiwitten: voorbeelden van eiwitten
EIWITSYNTHESE.
EIWITSYNTHESE.
Van genotype tot fenotype
Transcriptie en translatie van het DNA
Computer – DNA Een vergelijking. Computer DNA Hardware: elektronische verbindingen in chips Code binair(2-tallig): 0 en 1 Hardware: rug van suiker en.
De Cel, DNA.
DNA en DNA mutaties: celkern met DNA chromosoom
Werkzitting II Prof. F. Claessens.
Zoeken naar een bekend tijdschrift of artikel Demo Nyenrode bibliotheek.
DNA Erfelijke materiaal. Twee nucleotiden ketens
Hoe toegang krijgen tot de nieuwe webapplicatie? Ga naar onze website:
Sociological Abstracts Zoeken op auteur met samengestelde naam Universiteitsbibliotheek verder = klikken.
DNA en eiwitten.
Paragraaf 3.3 DNA vertaald.
HIV replicatie.
Paragraaf 3.4 Stabiliteit van DNA.
Thema 7 Genexpressie DEEL 3 Gentisch materiaal en celdelingen.
Hoofdstuk 14 Chemie van het leven.
Thema 8 Moleculaire genetica
Het zoek van onderdelen verbeteren?
?.

Inleiding keuzemodule TBK31
RFLPs SNPs Micro-array
BIO 42 Het centrale dogma.
Hybridisatie Blotten Probes maken Sequencen
of de synthese van eiwitten
From Gene to Protein (CHMBCM21) College 2, CHMBCM21
Trage Wegen Wachtebeke Op het web Op de GPS. Routes opzoeken …op het Web Trage Wegen Wachtebeke.
DNA, RNA en Eiwitsynthese
B5 translatie en eiwitsynthese
13.4. t/m De ruimtelijke vorm van eiwitten Nadat een eiwit in de cel is aangemaakt, vouwt het zich spontaan in een kluwen, die kenmerkend is voor.
6A1-Stofwisseling. B4 Eiwitsynthese (les3). Hoe haal je de INFO van het DNA? Volgorde van de ‘letters’ A-T-G-C = info. Één gen bevat de info voor één.
Noonan syndroom: nieuwe ontwikkelingen Ineke van der Burgt Klinische genetica UMC st Radboud Nijmegen.
EMGO Institute for Health and Care Research Quality of Care Martina Cornel, Hoogleraar community genetics & public health genomics Genetische testen: Direct.
2 DNA ©JasperOut.nl.
6A1 Stofwisseling B5 Regulatie van de genexpressie. B6 Mutaties.
De belangrijkste moleculen van leven
Eiwit synthese.
Zoeken naar een bekend tijdschrift of artikel
Zoek de humane hemoglobine subunit beta op in de UniprotKB/Swiss-Prot databank. Wat is het accessienummer van dit eiwit? P68871.
Delve.
Left-out? or LinkedIn or Left-out?.
CSI Oldenzaal.
DNA, RNA en Eiwitsynthese
DNA.
B- en T-cel diversiteit
Transcript van de presentatie:

Vraag 1: Ensembl – Humane actine Welke types informatie worden er gevonden naast gen informatie. Ensembl: www.ensembl.org

Vraag 1: Ensembl – Humane beta actine gen Wat is de accessie van deze entry en de locatie van het volledige gen in the genoom? Locatie: 7 (chromosoom) 5566782 (positie eerste nucleotide) 5567729 (positie laatste nucleotide) Accessie Locatie

Vraag 1: Ensembl – Humane beta actine gen Hoeveel coderende transcripten zijn er voor dit gen? 8 Wat is de lengte in baseparen en aminozuren? Coderende transcripten Lengte in baseparen Lengte in aminozuren

Vraag 1: Ensembl – Humane beta actine gen Hoeveel exonen vind je terug voor de ACTB-001 entry? 6 2 3 4 5 6

Vraag 1: Ensembl – Humane beta actine gen Zoek de transcriptie sequentie (via CCDS) van deze entry (ACTB-001). Verwacht je de drie eerste en laatste nucleotiden? Waarom? ATG (Met): startcodon TAG: stopcodon

Vraag 2: NCBI – Humane beta actine Welke onderzoeker (laatste auteur) wist als eerste het beta actine op chromosoom 7 te plaatsen? Shows

Vraag 2: NCBI – Humane beta actine Welke gekende snp(s) geven aanleiding tot een ziektebeeld? Vermeld ook de positie in het eiwit en de mutatie. Arg 183 → Trp

Vraag 2: NCBI – Humane beta actine Wat is de mutatie op nucleotide niveau? C → T Wat zijn het originele en gemuteerde triplet? CGG → TGG

Vraag 2: NCBI – Humane beta actine Wat is de mutatie op nucleotide niveau? C → T Wat zijn het originele en gemuteerde triplet? CGG → TGG Positie van de mutatie in de andere varianten

Vraag 2: NCBI – Humane beta actine Klik via de eiwitaccessie door naar de NCBI eiwit referentie. Wat is het moleculair gewich van humaan beta actine? 41 606 Da Vind je een link naar het UniProtKL/Swiss-prot eiwit? Wat is de accessie? P60709

Vraag 3: UniProtKB/Swiss-prot – Humane beta actine Ga naar de Uniprot website en zoek het humaan beta actine eiwit. Wat is de accessie? P60709 Komt die overeen met de eerder gevonden accessie? ja

Vraag 3: UniProtKB/Swiss-prot – Humane beta actine Welke natuurlijke sequentie variaties zijn er gekend voor dit eiwit? Arg 183 → Trp + Pro 243 → Leu Komen deze overeen met degene die je vond in de OMIM database? Niet in OMIM omdat deze mutatie geen ziektebeeld geeft.

Vraag 3: UniProtKB/Swiss-prot – Humane beta actine Ga via deze eiwit entry naar alle GO termen die gekend zijn voor dit eiwit. Hoeveel GO termen junnen er aan humaan beta actine gelinkt worden? 46 Wat is de GOid van axon guidance? 0007411

Vraag 3: UniProtKB/Swiss-prot – Humane beta actine Geef de dichtste parent term (part of) voor axon guidance. axonogenesis

Vraag 3: UniProtKB/Swiss-prot – Humane beta actine Hoeveel UniprotKB eiwitten kunnen er gelinkt worden aan deze parent term? 427

Vraag 3: UniProtKB/Swiss-prot – Humane alpha actine Zoek de Uniprot entry voor het humane actine eiwit. P68133 Wat is de tissue specificiteit van dit eiwit? spierweefsel

Vraag 3: UniProtKB/Swiss-prot – Humane alpha actine Wat is de accessie van de 3D structuur gelinkt aan alpha actine? 1T44