Evolutie van groenwieren: diepe fylogenetische relaties in de Chlorophyta en speciatie in Halimeda Eeckhout Justine Universiteit Gent, onderzoeksgroep.

Slides:



Advertisements
Verwante presentaties
Indeling van het dierenrijk.
Advertisements

Aanbod BIOgenie derde graad
Argumenten voor evolutie
Genregulatie en Epigenetica.
HET ONTSTAAN DER SOORTEN
RFLP Restrictiefragment-lengte polymorfisme
EVOLUTIE en INFORMATIEOVERDRACHT
Onderwijsmiddag 24 Mei 2005 Onderwijsmiddag 24 juni 2005 "Digitale toetsen en multiple choice examens: didactische hulpmiddelen en vermindering nakijkwerk"
Medicijnontwikkeling
Zoeken naar Rho's Jullie hebben met BLAST gezocht naar Rho in planten...  En die hebben jullie gevonden, maar... Lijken ze meer op Rac, Rho of Cdc42?
De zoektocht naar functionaliteit in het post-genoom tijdperk
LENGTE METEN VAN EEN GENOOM
Evolutie Thema 6.
Evolutie Duurt miljoenen jaren.
Hoofdstuk 10 : Van DNA tot eiwit
Relaties in de natuur Planten produceren zuurstofgas
Systematiek De eerste die probeerde een systematische indeling te maken was Aristoteles ( voor Christus). Bijna alle wetenschappers uit zijn tijd.
Orde scheppen in een verscheidenheid aan soorten
De roodhalsganzen overwinteren in Nederland
Initiatief Bijstellen Analyse Evaluatie Probleemstelling Netwerken
Hfst 1 paragraaf 3 Enkelvoudige ionen.
Practicum Gentechnologie II. Overzicht DOEL & SITUERING PRACTICUM: de stappen PRAKTISCHE RICHTLIJNEN EVALUATIE & QUOTATIE.
De Cel, DNA.
HK07 – Les 3 Meervoudige alignering Yves Moreau 3de jr. Burg. Ir. Elektrotechniek Dataverwerking & Automatisatie
Dissimilatie op celniveau
Keuze-opdracht 3-1.
Organische stoffen Anorganische stoffen.
Instapquiz AK HAVO 3 Periode 1
Gemaakt door : stefan en roelof uit H2B Paragraaf 3.1 en3.2
1 Ontwerp van een hardware-versneller voor de vergelijking van DNA-sequenties Promotoren: Prof. Stroobandt (ELIS) Prof. Van de Peer (PSB) Begeleiders:
Vorige keer…. De ontwikkeling van het leven in het water.
Vorige keer…. De evolutietheorie gaat uit van: - Verandering in genotypen - Natuurlijke selectie - Het ontstaan van nieuwe soorten Mutanten binnen een.
Par Planten Planten zijn: AUTOTROFE EUKARYOTEN
Bridging science to practice
Thema 8 Moleculaire genetica
Tijd van jagers en boeren – – 3000 VC
Thema 8 Moleculaire genetica
BIO 42 Transcriptie.
BIO 42 Het centrale dogma.
Ordening en Evolutie ‘Het is een teken van een geschoolde geest als iemand kan nadenken over een gedachte zonder ze te aanvaarden’  Aristoteles.
DNA, RNA en Eiwitsynthese
13.4. t/m De ruimtelijke vorm van eiwitten Nadat een eiwit in de cel is aangemaakt, vouwt het zich spontaan in een kluwen, die kenmerkend is voor.
Q koorts en laboratorium testen Geitenbedrijven worden via de tankmelk getest op Qkoorts Er kan getest worden op antigeen: de Qkoorts bacterie (Coxiella.
Antibiotica Het woord ‘antibiotica’ is de meervoudsvorm van ‘antibioticum’. Er zijn inmiddels zeer veel antibiotica ontdekt.
Zelfstandigheidproject 3 VWO
Geleedpotigen en gewervelden
De reproduceerbaarheid van de immuno- histochemische MSI- screening nagaan Julie De Cabooter AZ Alma Campus Eeklo – Anatome Pathologie.
Evaluatie van een genotypische test voor detectie van polymorfismen in het integrase gen van verschillende HIV-1 subtypes De Ruddere Annelies.
Bepaling van de microbiële diversiteit op mariene sedimenten via DGGE profielen voor het bepalen van de mogelijke impact van antropogene activiteiten Howest.
PP Thema 2 ZW klas 3. §1 Organismen ordenen Een organisme is een levend wezen. Ordenen is organismen in groepen indelen. Je doet dit door naar de kenmerken.
SN 2013fs Nature Physics Supernova van rode superreus
4.3.
Praktische opdracht Thema 3: Ecologie
Bachelorproef Academiejaar Cédryck Pauwels FBT
4 De wetenschap & het vraagstuk van het ontstaan van leven
3 DOMEINEN Uit door endosymbiose Par. 5 blz. 112) ontstaan cellen hebben zich de huidige organismen ontwikkeld die we kunnen onderbrengen in 3 domeinen:
Eiwit synthese.
12.4 Dissimilatie Dissimilatie is het afbreken van grotere moleculen in kleinere, waarbij energie vrijkomt en wordt vastgelegd in de vorm van ATP. Deze.
Erfelijkheid en evolutie
Tijd van jagers en boeren – – 3000 VC
Ontwikkeling en validatie van microsatellieten voor de soort Dictyota dichotoma (Dictyotales, Phaeophyceae) Dewilde Frederik Universiteit Gent Onderzoeksgroep.
Thema 5, evolutie.
B. Stof 2 Prokaryoten B. Stof 3 Eukaryoten
Biologie 2.6 Gezondheid 2.5. Voeding 1.4. Organisme 2.4. Regeling
Transcript van de presentatie:

Evolutie van groenwieren: diepe fylogenetische relaties in de Chlorophyta en speciatie in Halimeda Eeckhout Justine Universiteit Gent, onderzoeksgroep Algologie

Overzicht Situering Probleemstelling en doel Moleculair onderzoek  Fylogenetisch onderzoek in Halimeda Conclusie  Hybride speciatie in Halimeda op basis van nucleaire genen Fylogenetisch onderzoek in de Chlorophyta Conclusie  Diepe fylogenetische relaties binnen de Chlorophyta

Situering Algen: diverse groep van autotrofe eukaryoten die voornamelijk in waterig milieu leven Evolutie op basis van morfologische kenmerken Evolutie op basis van moleculair fylogenetisch onderzoek Hybriden ontstaan wanneer twee verschillende soorten met elkaar kruisen

Situering Halimeda binnen de groep Bryopsidales (Ulvophyceae) Zeer groot ondanks het maar bestaat uit één enkele cel

Probleemstelling Halimeda Doel: Hybride speciatie onderzoeken in het Halimeda

Probleemstelling Chlorophyta: Trebouxiophyceae Doel: Diepe fylogenetische relaties achterhalen in de Chlorophyta: Trebouxiophyceae

Moleculair onderzoek Groenwierstalen verzamelen DNA/RNA extractie PCR Gelelektroforese Sequeneren Aligneren Construeren van een fylogenetische boom PCR, extractie of kloneren

Fylogenetisch onderzoek in Halimeda 12/15 stalen Vier nucleaire genen worden onderzocht (EF1a, G6PI, GapA en Rpl3) Slecht twee genen (EF1a en G6PI) geven geslaagde sequentie Totaal alignement van EF1a van 1031 posities Enkel van EF1a kan een fylogenetische boom gemaakt worden

Speciatie in Halimeda EF1A 18S rDNA

Conclusie  Fylogenetische boom van EF1a-gen bevestigt de verwantschappen op basis van 18S rDNA  Om hybride speciatie te achterhalen moeten meerdere nucleaire genen onderzocht worden Hybride speciatie in Halimeda op basis van nucleaire genen

Fylogenetisch onderzoek in de Chlorophyta 13 stalen Zeven chloroplastgenen worden onderzocht Zes genen geven bruikbare sequenties waarvan fylogenetische boom van gemaakt wordt Op basis van RNA =>geen positieve resultaten Totaal alignement van posities Zowel boom op basis van DNA sequenties als op aminozuur sequenties

Groenwierfylogenie Dna sequentiesAminozuur sequenties DNA Aminozuur

Groenwierfylogenie Dna sequentiesAminozuur sequenties Aminozuur DNA

Groenwierfylogenie Dna sequentiesAminozuur sequenties

Conclusie  De fylogenetische verwantschappen binnen de Chlorophyceae zijn opgehelderd  Slechts enkele relaties binnen de Trebouxiophyceae zijn achterhaald  Analyse van meer genen zal nodig zijn om de fylogenie van deze groep op te helderen  Diepe fylogenetische relaties binnen de Chlorophyta Verder onderzoek is noodzakelijk!

Evolutie van groenwieren: diepe fylogenetische relaties in de Chlorophyta en speciatie in Halimeda Eeckhout Justine Universiteit Gent, Onderzoeksgroep Algologie

Zoogdieren Primaten Mensachtigen Homo Homo Sapiens Chordadieren Dieren Eukaryoten