Diagnostiek naar Pseudomonas bij CF: nieuwe grenzen

Presentatie over: "Diagnostiek naar Pseudomonas bij CF: nieuwe grenzen"— Transcript van de presentatie:

1 Diagnostiek naar Pseudomonas bij CF: nieuwe grenzen
Hoog prevalente Pseudomonas aeruginosa stammen Rosa van Mansfeld Lieke de Vrankrijker CF symposium UMCU 2008

2 Pseudomonas aeruginosa en CF
Infectie met Pseudomonas aeruginosa (PA) belangrijke oorzaak van morbiditeit en mortaliteit 3 fasen PA kolonisatie: geen PA intermitterend chronisch

3 Acquisitie van Pseudomonas
Vroeger : Patiënten dragen unieke stammen die ze verwerven uit de omgeving Alleen gezinsleden “delen” stammen Nu: Groepen patiënten zijn gekoloniseerd met dezelfde stam Transmissie van stammen tussen patiënten is aangetoond

4 Internationale prevalente stammen
Jaar Lokatie Patiënten Clone C 1994 Hannover, wereld (2005) 13 Liverpool 1996 55 Melbourne PT1 2000 Melbourne 55% Manchester 2001 22 Norway Oslo 27 Pulsetype 2 2004 Brisbane 59 Midlands Engeland/Wales 86 Copenhagen 2007 Kopenhagen 6

5 Onderzoeksvragen Prevalentie van PA stammen in NL CF populatie is niet goed gedocumenteerd Is er een “Nederlandse” prevalente stam? Is deze anders dan bekende (internationale) prevalente stammen?

6 Opzet onderzoek cross-sectioneel CF centra Utrecht en Den Haag
eerste PA positief sputum in 2007 typering met multi locus sequence typing (MLST) 6

7 Onderzoekspopulatie

8 Populatie UMCU en Haga UMCU Haga Totaal 386 210 M:V (%)
212:174 (55:45) 105:105 (50:50) leeftijd 19,4 jr 30,6 jr PA pos (%) 219 (61) 121 (62) 109:93 (54:46) 61:60 (50:50) 22,5 jr 32,5 jr Opvallend is het verschil in leeftijd tussen de ziekenhuizen Kolonisatie is gelijk=61%, ook daar zet leeftijdsverschil door

9 MLST (multi locus sequence typing)
DNA aflezen 7 huishoudgenen profiel “sequence type” C B A G D E F

10 Sequence Typen (STs) van alle getypeerde patiënten
UMCU (174 patiënten) Haga (93 patiënten) Totaal (267 patiënten) uniek ST 48 (28%) 32 (34%) 80 (30%) gedeeld ST 113 (64%) 54 (58%) 167 (62%) uniek + gedeeld ST 13 (7%) 7 (8%) 20 (7%) Opvallend is dat maar 30% een unieke stam draagt en de overgrote meerderheid een gedeelde stam

11 Hoog prevalente ST’s 43 gedeelde ST’s ST 406 41 patiënten ST 497
41 andere ST’s elk bij <10 patiënten

12 Hoog prevalente ST’s en leeftijd

13 Patiënten met ST406 en ST497 wonen in heel Nederland

14

15 Vergelijken van ST’s Rob Willems profiel van 393 verschilt van profiel 554 in 2 posities profiel van 393 verschilt van profiel 417 in 1 positie profiel van 393 verschilt van profiel 397 in 1 positie

16 Afstandstabel: aantal verschillende posities
Rob Willems

17 Bouwen van de “boom” Rob Willems Verbind elk type met een ander type met de kleinst mogelijke afstand 394 400 1 397 1 393 2 554 1 552 1 417 1 401 2 1 549

18

19 Conclusies 62% van de PA positieve patiënten heeft een gedeeld ST
Twee hoog prevalente P. aeruginosa ST’s in Nederlandse CF populatie (ST406 en ST 497) Beide ST’s verschillen van bekende internationale stammen

20 Verder onderzoek Klinische relevantie? Risicofactoren? Transmissie?

21 Vragen