B: Spiereiwit online knippen met knipenzymen

Presentatie over: "B: Spiereiwit online knippen met knipenzymen"— Transcript van de presentatie:

1 B: Spiereiwit online knippen met knipenzymen

2 Project B: Online knippen van het eiwit myosine
MSSDQEMAIFGEAAPYLRKSEKERIEAQNKPFDAKTSVFVAEPKESFVKGTIQSREGGKV TVKTEGGATLTVKEDQVFPMNPPKFDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSG LFCVTVNPYKWLPVYNPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGE

3 Structuur van spieren vanaf atoom opgebouwd

4 CHEM: Cysteine (C), Histidine (H), Glutaminezuur (E) & Methionine (M)

5

6 Eiwitmolecuul (atoom = 10-7 mm) Atomen/bindingen Lintmodel

7 Eiwitmolecuul (atoom = 10-7 mm) Atomen/bindingen Lintmodel

8 Lintmodel uiteinde van myosine

9 Myosine helemaal: 1,5 x 10-4 mm

10

11

12 Video: Myosine trekt spieren samen Details onbelangrijk!
0-2min09 & 4min00 – 4 min 23

13 Uitleg project B: Online knippen Myosine

14 Elke letter is 1 aminozuur Kopieer de aminozuren met je muis…
MSSDQEMAIFGEAAPYLRKSEKERIEAQNKPFDAKTSVFVAEPKESFVKGTIQSREGGKV TVKTEGGATLTVKEDQVFPMNPPKFDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSG LFCVTVNPYKWLPVYNPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGE

15 Open je browser (bv Firefox) Ga naar: www. web. expasy
Open je browser (bv Firefox) Ga naar:

16 Klik in het rechthoekje rechtsboven

17 Rechter muisknop  paste
MSSDQEMAIFGEAAPYLRKSEKERIEAQNKPFDAKTSVFVAEPKESFVKGTIQSREGGKV TVKTEGGATLTVKEDQVFPMNPPKFDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSG LFCVTVNPYKWLPVYNPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGE

18 Kies nu: eigen selectie knip-enzymen:
Please, select all available enzymes and chemicals only the following selection of enzymes and chemicals

19 Vink aan 1 of meer van de volgende 5: chymotrypsin high specificity / CNBr / iodobenzoic acid / neutrophil elastase / trypsin

20 Klik op: “Perform” Beneden staan nu de knipplaatsen De knipplek is direct rechts na een streepje

21 Zo moet het er ongeveer uit zien: