DNA reparatie in zoogdieren.

Presentatie over: "DNA reparatie in zoogdieren."— Transcript van de presentatie:

1 DNA reparatie in zoogdieren

2 Over welk DNA in zoogdieren hebben we het dan?
DNA in het Genoom 1 2

3 dubbele Breuk Base verlies enkele Breuk Pyrimidine dimeer Base extra Base verandering breuk H-brug dubbele Breuk Pyrimidine dimeer Base verlies DNA cross-link Base verandering Base extra cross-link niet parende Basen Eiwit-DNA cross-link beschadiging Ruggegraad enkele Breuk

4 dubbele Breuk Base verlies enkele Breuk Pyrimidine dimeer Base extra Base verandering breuk H-brug DNA cross-link cross-link niet parende Basen Eiwit-DNA cross-link beschadiging Ruggegraad

5

6 Externe factoren Interne factoren

7

8

9

10

11

12 Externe factoren Interne factoren

13 Metabolisme: Mitochondriën -> Zuurstofradicalen
P450 afhankelijke reacties Auto-oxidatieve Hemoglobine Auto-oxidatieve Lipiden Fagocyten NADPH oxidase Spontaan Cytocine -> Uracil Spontaan 5 methyl-Cytocine ->Thymine Polymerase α 1/ fout (geen proofreading) Polymerase δ 1/ fout (proofreading) O2-

14 Schade 600.000 dimeren door UVB in DNA per dag / cel in Texas
DNA schade door radicalen per dag / gezonde cel totale DNA schade per dag / gezonde cel

15 Pathologie Instabiel genoom, Kortere levens verwachting
Diabetes I, depletie Mitochondriën -> hartfalen Longemfyseem Stralingsziekte Kanker

16 Celcyclus

17 1 Nucleotide excision repair (NER )

18 1 Nucleotide excision repair (NER )
Prof. J. Hoeijmakers Prof. D. Bootsma

19 Xeroderma Pigmentosum
1 Nucleotide excision repair (NER ) Xeroderma Pigmentosum

20 1 Nucleotide excision repair (NER )
Cockayne syndroom

21 1 Nucleotide excision repair (NER )
Trichothiodystrophy

22 1 Nucleotide excision repair (NER )

23 1 Nucleotide excision repair (NER )

24

25

26

27

28 2 Mismatch repair (A-G, T-G, C-A, C-T)

29 2 Mismatch repair (A-G, T-G, C-A, C-T)

30 2 Mismatch repair (A-G, T-G, C-A, C-T)

31 2 Mismatch repair (A-G, T-G, C-A, C-T)

32 2 Mismatch repair (A-G, T-G, C-A, C-T)

33 3 Base excision repair

34 3 Base excision repair

35 3 Base excision repair

36 3 Base excision repair

37 3 Base excision repair

38 BER 1 NER 2 MMR 3 Base schade Pyrimidine dimeer Mismatch
Herkenning, incisie, excisie Reparatie, synthese Ligatie

39 Telomerase: (Kiembaancellen, Stamcellen, Kankercellen)
4 Bescherming uiteinde chromosomen 3 tot 20 kilobasen 100 tot 300 kilobasen Telomerase: (Kiembaancellen, Stamcellen, Kankercellen)

40 5 Reparatie van enkele en dubbele DNA breuken

41 5 Reparatie van enkele en dubbele DNA breuken

42 5 Reparatie van enkele en dubbele DNA breuken

43 5 Reparatie van enkele en dubbele DNA breuken

44 5 Reparatie van enkele en dubbele DNA breuken

45 5 Reparatie van enkele en dubbele DNA breuken

46 5 De bron van meeste enkele/dubbele DNA breuken?

47 Probleem Evolutie ‘Gecontroleerde’ VERBRANDING m.b.v. .. O2

48

49 C - C - C - C - C ATP

50 O2- . O2- . O2- .

51 O2- . O2- . O2- . O2- . O2- . O2- . O2- .

52 O2- . O2- . O2- .

53 O2- .

54 5 Reparatie van enkele en dubbele DNA breuken

55 5 Reparatie van enkele en dubbele DNA breuken

56 PARP verbruikt alle NAD+/ATP
O ATP NAD Polymeer ( NAD-moleculen/breuk) (Bevorderd reparatie van DNA) O2- . Acceptabele schade Goedeireparatie DNA Grote DNA schade PARP verbruikt alle NAD+/ATP NECROSE † PARP 5 Reparatie van enkele en dubbele DNA breuken

57 5 Reparatie van enkele en dubbele DNA breuken

58 DNA reparatie in zoogdieren