Genomic Selection in Dairy Cattle

Presentatie over: "Genomic Selection in Dairy Cattle"— Transcript van de presentatie:

1 Genomic Selection in Dairy Cattle
Dr.Wuttigrai Boonkum

2 Genomic Selection Dairy cattle most are specialised dairy breed
Holstein, Jersey, Brown Swiss, Ayrshire Some dual propose Simmental, Montbeliarde, Normande, etc More than 80% AI from AI companies Global exchange of genetic so international genetic evaluation

3 P = G + E Genomic Selection Genetic evaluation or Molecular genetics
Appropriated major gene only Need time and data complete

4 Genomic Selection, What does it bring us?
European R&W Conference Genomic Selection, What does it bring us? Reliable breeding values at young age higher success rate to get top bulls lower costs for test proofs shorter generation-interval Toelichting geven

5 Reliability of breeding values
European R&W Conference Reliability of breeding values Voor Genomic Selection is een referentiepopulatie nodig bestaande uit stieren die EN een gerealiseerde fokwaarde hebben, EN getypeerd zijn voor de merkers. Op basis van de referentiepopulatie kunnen de merkereffecten worden geschat. Op basis van deze merkereffecten kan dan de GS fokwaarde van getypeerde kalveren worden bepaald. 1300 stieren met fokwaarde zijn getypeerd. Een validatiestudie is uitgevoerd. In de validatiestudie wordt van een deel van de stieren de gerealiseerde fokwaarde weggegooid, en wordt vervolgens bekeken hoe goed de merkerfokwaarde van de stier dan de gerealiseerde fokwaarde voorspelt. Op basis van de validatiestudie is de conclusie dat GS fokwaarden met een betrouwbaarheid van 50% realistisch is voor de huidige stand van de techniek. Deze 50% geldt voor dieren zonder eigen prestatie en zonder nakomelingen. Het is (afhankelijk van het kenmerk) een % hoger dan de traditionele verwachtingswaarde. Voor dieren die al wel eigen prestatie of nakomelingen hebben is de toegevoegde waarde van GS minder (zie de tabel). 50% reliability is realistic

6 Advantages of Genomic Selection
Increased genetic improvement (30-40%) Higher genetic level of test sires Higher genetic level of Delta embryo’s Wider portfolio of commercial bulls & higher level More outcross; less inbreeding

7 Disadvantages of Genomic Selection
New method, not fully proven or tested Need to genotype a sufficiently large set of animals for accurate GEBV Across breed accuracy low Genotypes still costly (10,000 bath/head)

8 1. การกำหนดเป้าหมายของการปรับปรุงพันธุ์โคนม

9 1. การกำหนดเป้าหมายของการปรับปรุงพันธุ์โคนม
องค์ประกอบน้ำนม ผลผลิตน้ำนม ความสมบูรณ์พันธุ์ ลักษณะการต้านทานโรค ลักษณะโครงร่าง

10 พันธุ์โคนมของประเทศไทย
TMZ TF Friebrah

11 Dairy cattle crossbreds
3. การใช้ระบบผสมข้ามพันธุ์ที่เหมาะสม Table 3 Comparison of average of milk yield, reproductive performance and economic returns of Thai Friesian (TF), Thai milking zebu (TMZ) and Friebrah (FB) Dairy cattle crossbreds Traits TF TMZ FB Milk yield (kg/head/lactation) Milk yield (kg/head/day) Day in milk (day) First oestrus after calving (day) Calving interval (day) Number of service per conception (times) Income (baht/lactation) Production cost (baht/lactation) Milk production cost (baht/kg) Net profit (baht) 4, 52,406.01 29,795.39 6.37 22,610.62 3, 45,269.87 28,032.08 7.49 17,237.79 2, 28,676.24 24,646.17 9.91 4,030.07 Source: (สดใส และคณะ, 2549 ก,ข)

12 4. การใช้พันธุศาสตร์โมเลกุลในการปรับปรุงพันธุ์โคนม
Heritability high medium, low BLUP BLUP Traditional Selection index by MT-BLUP MAS Selection index by MA-BLUP Selection index including MA information Pre-selection by marker confirmed by MT-BLUP index Figure 6 Dairy cattle improvement using BLUP and genetic marker scheme