B: Spiereiwit online knippen met knipenzymen
Project B: Online knippen van het eiwit myosine MSSDQEMAIFGEAAPYLRKSEKERIEAQNKPFDAKTSVFVAEPKESFVKGTIQSREGGKV TVKTEGGATLTVKEDQVFPMNPPKFDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSG LFCVTVNPYKWLPVYNPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGE
Structuur van spieren vanaf atoom opgebouwd
CHEM: Cysteine (C), Histidine (H), Glutaminezuur (E) & Methionine (M)
Eiwitmolecuul (atoom = 10-7 mm) Atomen/bindingen Lintmodel
Eiwitmolecuul (atoom = 10-7 mm) Atomen/bindingen Lintmodel
Lintmodel uiteinde van myosine
Myosine helemaal: 1,5 x 10-4 mm
Video: Myosine trekt spieren samen Details onbelangrijk! https://www.youtube.com/watch?v=BMT4PtXRCVA 0-2min09 & 4min00 – 4 min 23
Uitleg project B: Online knippen Myosine
Elke letter is 1 aminozuur Kopieer de aminozuren met je muis… MSSDQEMAIFGEAAPYLRKSEKERIEAQNKPFDAKTSVFVAEPKESFVKGTIQSREGGKV TVKTEGGATLTVKEDQVFPMNPPKFDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSG LFCVTVNPYKWLPVYNPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGE
Open je browser (bv Firefox) Ga naar: www. web. expasy Open je browser (bv Firefox) Ga naar: www.web.expasy.org/peptide_cutter/
Klik in het rechthoekje rechtsboven
Rechter muisknop paste MSSDQEMAIFGEAAPYLRKSEKERIEAQNKPFDAKTSVFVAEPKESFVKGTIQSREGGKV TVKTEGGATLTVKEDQVFPMNPPKFDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSG LFCVTVNPYKWLPVYNPEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGE
Kies nu: eigen selectie knip-enzymen: Please, select all available enzymes and chemicals only the following selection of enzymes and chemicals
Vink aan 1 of meer van de volgende 5: chymotrypsin high specificity / CNBr / iodobenzoic acid / neutrophil elastase / trypsin
Klik op: “Perform” Beneden staan nu de knipplaatsen De knipplek is direct rechts na een streepje
Zo moet het er ongeveer uit zien: